昌平实验室陈明辰团队推出了一款开源抗体设计工具PPIFlow。它能不依赖已有实验数据，直接从头生成高亲和力的结合剂和纳米抗体，效果达到皮摩尔级（即极强结合能力）。该工具整合了生成、优化和筛选全流程：先用SE(3)流匹配技术精准模拟蛋白质骨架的三维运动；再通过两步策略——聚焦抗体-抗原结合界面的关键氨基酸，并在计算过程中加入噪声再重建——来模拟生物体内自然发生的“亲和力成熟”过程。相比传统方法，PPIFlow可大幅提升抗体设计的准确性和可解释性，大幅缩短研发周期，减少对大量实验室试错的依赖。