高新技术企业所得税按纳税年度计算，而高新证书的发证时间通常为年中某一日期，并非完整纳税年度。尽管证书有效期为三年，实际涉及四个纳税年度，导致优惠期与证书有效期不完全匹配。
根据《国家税务总局公告2018年第45号》规定，高新技术企业资格所属年度以证书注明的有效期所属年度为准，企业在该年度内可享受15%的优惠税率。
优惠期起始规则
企业自证书注明的发证年度起，连续三年享受15%优惠税率，不受发证具体月份影响。例如：若证书发证时间为20X5年7月1日，则企业可从20X5年1月1日起享受优惠，对应优惠年度为20X5、20X6和20X7年。
期满当年税务处理
高新技术企业资格期满当年，在通过重新认定前，可暂按15%预缴企业所得税。若在当年年底前重新取得高新资格，则继续享受15%优惠；如未重新取得资格，需按25%税率补缴全年税款差额（即补缴10%部分）。
例如：某企业高新资格于20X8年7月1日到期，20X8年季度申报时可暂按15%预缴。若年底前未能重新认定成功，则须按25%补缴20X8年度全部应纳税款。
结论
为确保持续享受15%优惠税率，高新技术企业应在证书有效期届满当年完成重新认定，避免因资格中断导致补税风险。