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Nat Neuroscience |神经领域的空间组学分析技巧很适合咱们学

Nat Neuroscience |神经领域的空间组学分析技巧很适合咱们学 生信钱同学
2026-01-13
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导读:空间代码学习,scATAC学习
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突破性研究揭示母体环境对胎儿脑免疫景观的关键影响 性别特异性机制浮出水面

近日,一项发表于《自然・神经科学》(Nature Neuroscience)的研究通过空间转录组学技术,绘制出孕中后期小鼠胚胎大脑的高分辨率神经免疫景观图谱,揭示了母体免疫激活(MIA)和微生物组耗竭(MMD)对胎儿脑发育的深远影响,且发现其作用存在显著性别特异性。该研究为理解神经发育障碍(NDDs)的发病机制提供了全新视角。

研究团队采用多重抗错荧光原位杂交(MERFISH)技术,对 E14 和 E18 两个关键发育阶段的小鼠胚胎大脑进行分析,聚焦 500 个免疫相关基因的表达模式。结果显示,胚胎大脑的神经免疫景观随发育动态变化:从 E14 到 E18,神经前体细胞比例下降,胶质生成前体细胞及成熟神经元增多,小胶质细胞相关基因模块呈现高度动态性,而内侧神经节隆起(MGE)中间神经元相关基因模块则保持稳定。

核心发现之一是母体环境扰动对神经免疫景观的重塑作用。研究通过注射聚肌胞苷酸(Poly (I:C))诱导 MIA,或通过抗生素鸡尾酒处理实现 MMD,发现这两种干预均会导致雄性胚胎出现皮质成熟异常、神经发生减少及神经元迁移紊乱,表现为 CTIP2 + 深层皮质神经元层增厚,而脑室下区 / 脑室区(SVZ/VZ)的 Ki67 + 增殖细胞减少。行为学测试进一步证实,MIA 和 MMD 组雄性后代存在社交互动异常和焦虑样行为,雌性后代则无显著变化。

更关键的是,研究发现 CXCL12/CXCR7 趋化因子网络是 MIA 和 MMD 影响神经发育的共同关键通路。MIA 会导致雄性胚胎多种细胞中 Ackr3(编码 CXCR7)表达升高,而 MMD 则使雌雄胚胎的 Ackr3 表达均上调,但雄性纹状体抑制性神经元中表达更高。体外实验证实,雄性神经前体细胞对 CXCL12 更敏感,暴露后更易分化为成熟神经元,这与雄性胚胎 Ackr3 基因非编码区染色质可及性更高的表观遗传特征一致。

研究还通过单细胞转座酶可及染色质测序(snATAC-seq)发现,E12 胚胎大脑已存在性别特异性表观遗传差异。雄性胚胎干扰素相关基因位点(如 Ifngr1)和 Ackr3 基因非编码区可及性更高,而雌性胚胎神经发生调控因子(如 Cux2、Foxp1)相关区域可及性更显著。这些表观遗传差异可能是胚胎对母体环境扰动产生性别特异性响应的分子基础。

这项工作构建的空间转录组资源填补了发育中大脑神经免疫研究的空白,明确了 CXCL12/CXCR7 轴在介导母体环境对胎儿脑发育影响中的核心作用,且揭示了性别特异性 vulnerability 的表观遗传机制。这一发现为神经发育障碍的早期干预提供了潜在靶点,尤其为理解男性在自闭症等疾病中发病率更高的现象提供了重要线索。

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Kukreja, B., Jeon, S., Cao, W. et al. Spatial transcriptomics of the developing mouse brain immune landscape reveals effects of maternal immune activation and microbiome depletion. Nat Neurosci (2026).

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