• 非营利性医疗机构自用的房产、土地、车船，免征房产税、城镇土地使用税和车船使用税；
• 营利性医疗机构自取得执业登记之日起3年内，其自用的房产、土地、车船免征上述三税（财税〔2000〕42号）。

1. 政府财政负担的免费疫苗调拨或发放，不征收增值税（国税函〔1999〕191号）。
2. 药品生产企业向患者免费提供的自产创新药（经批准且首次上市），不属于视同销售范围，不征增值税（财税〔2015〕4号）。

1. 残疾人组织进口供残疾人专用的物品，免征增值税（《增值税暂行条例》第十五条）。
2. 血站供应给医疗机构的临床用血，免征增值税。血站指依据《献血法》设立的公益性采供血机构（财税字〔1999〕264号）。
3. 非营利性医疗机构自产自用制剂，免征增值税；营利性医疗机构自执业登记起3年内，其自产自用制剂用于改善医疗条件的，免征增值税（财税〔2000〕42号）。
4. 医疗机构提供的医疗服务免征增值税。服务范围包括医学检查、诊断、治疗、康复、预防、保健、防疫等，《全国医疗服务价格项目规范》内项目均可享受优惠，且须按政府指导价或协商定价执行（财税〔2016〕36号附件3）。
5. 自2019年2月1日至2027年12月31日，医疗机构接受其他医疗机构委托提供符合规定的医疗服务，可继续适用免征增值税政策（财税〔2019〕20号、2021年第6号公告、2023年第68号公告）。
6. 境内单位和个人销售的医疗服务免征增值税，财政部另有规定适用零税率的除外（财税〔2016〕36号附件4）。
7. “宫内节育器”（税则号90189080）自2004年5月1日起免征进口环节增值税（财关税〔2004〕17号）。
8. 科研、教学、医疗活动暂时进境的设备，在符合条件并提供担保情况下，可暂不缴纳进口环节增值税和消费税，并应在6个月内复运出境，可申请延期（财关税〔2004〕7号）。单票货物进口环节增值税或消费税税额不足50元的，免征。

1. 卫生防疫站调拨生物制品及药械，可按小规模纳税人3%征收率计征增值税（国税发〔2009〕10号）。
2. 一般纳税人单采血浆站销售非临床用人体血液，可选择按3%简易计税，不得开具专票；选定后36个月内不得变更（国税函〔2009〕456号、国家税务总局公告2014年第36号）。
3. 自2018年5月1日起，抗癌药品生产、批发、零售环节，一般纳税人可选择按3%简易计税；进口抗癌药品减按3%征收进口环节增值税（财税〔2018〕47号）。
4. 自2019年3月1日起，罕见病药品（含制剂及原料药）生产、批发、零售环节，一般纳税人可选择按3%简易计税；进口罕见病药品减按3%征收进口环节增值税，清单动态调整（财税〔2019〕24号）。

新药研制的临床试验费属于允许加计扣除的研发费用范围（财税〔2015〕119号）。

2021年1月1日至2025年12月31日，医药制造企业发生的广告费和业务宣传费支出，不超过当年销售（营业）收入30%的部分准予扣除，超过部分准予结转以后年度扣除。关联企业可通过分摊协议实现税前扣除转移（财政部 税务总局公告2020年第43号）。

在一个纳税年度内，纳税人医保目录范围内个人负担累计超过15000元的部分，在办理汇算清缴时可在80000元限额内据实扣除。可由本人或配偶扣除；未成年子女支出可由父母一方扣除（国发〔2018〕41号第十一条、第十二条）。

1. 非营利性医疗机构自用房产免征房产税；营利性医疗机构自执业登记起3年内，其用于改善医疗条件的自用房产免征房产税（财税〔2000〕42号）。
2. 血站自用房产免征房产税（财税字〔1999〕264号）。
3. 疾病控制机构、妇幼保健机构等卫生机构自用房产免征房产税（财税〔2000〕42号）。

1. 非营利性医疗机构自用土地免征城镇土地使用税；营利性医疗机构自执业登记起3年内，其用于改善医疗条件的自用土地免征该税（财税〔2000〕42号）。
2. 血站自用土地免征城镇土地使用税（财税字〔1999〕264号）。
3. 疾病控制、妇幼保健等机构自用土地免征城镇土地使用税（财税〔2000〕42号）。

国家机关、事业单位、社会团体、军事单位及非营利性医疗机构承受土地、房屋权属用于门诊部及其他直接医疗用途的，免征契税。适用主体须为县级以上卫生健康行政部门批准设立的医疗机构（《契税法》第六条、财政部 税务总局公告2021年第23号）。

医疗机构占用耕地用于专门从事疾病诊断、治疗活动的场所及其配套设施，免征耕地占用税。但职工住房占地需按规定缴税（《耕地占用税法》第七条、财政部公告2019年第81号第九条）。