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Nat. Chem.:手性α-氨基酸合成新方法——1,3-氮迁移
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Nat. Chem.:手性α-氨基酸合成新方法——1,3-氮迁移
X-MOL资讯
2022-05-12
2
导读:美国欧柏林学院的Shuming Chen教授和德国马尔堡大学的Eric Meggers教授等研究者基于立体选择性控制1,3-氮迁移策略,成功地构建了一系列手性α-氨基酸。
手性α-氨基酸在天然产物合成、配体设计、药物研发、蛋白质及遗传基因工程等领域具有重要的作用。目前,最直接最高效合成手性α-氨基酸的策略是从廉价易得的羧酸的α-位对映选择性引入氨基。尽管化学家已经开发出许多直接不对称C(
sp
3
)-H 键胺化的方法(借助C-H 基团的酸性进行亲电胺化),但是现有方法大多是以醛、酮或二羰基化合物为起始材料,同时要使用重氮化合物作为亲电胺化试剂,这通常会导致胺化产物。如图1a所示,将氮宾插入C-H键为C(
sp
3
)-H键胺化提供了一种可调的替代方案,这是因为过渡金属配位可以控制氮宾的反应性。近年来,化学家利用手性过渡金属催化剂控制氮宾插入将前手性C(
sp
3
)-H键对映选择性地转化为C-N键,但分子间氮宾插入会存在区域选择性和对映选择性问题(图1b),而分子内C(
sp
3
)-H键胺化反应则缺乏普遍适用性。基于上述,要想将氮宾对映选择性插入潜手性C(
sp
3
)-H键来构建光学活性无环胺以及手性α-氨基酸仍然是一项巨大的挑战。
图1. 立体控制氮宾选择性插入C(
sp
3
)-H构建α-氨基酸。图片来源:
Nat. Chem.
近日,
美国
欧
柏林
学院
的
Shuming Chen
教授和
德国
马尔堡大学
的
Eric Meggers
教授等研究者基于
立体选择性控制1,3-氮迁移策略
(图1c)
,成功地构建了一系列手性α-氨基酸
。具体而言,从廉价易得的羧酸原料出发,先与氮宾前体进行共价连接(结合了分子内和分子间C-H键氮宾插入的优势),然后经钌或铁催化的高区域选择性和对映选择性C(
sp
3
)-H键胺化反应,简单高效地制备了一系列具有芳基、烯丙基、炔丙基和烷基侧链的光学活性α-氨基酸,同时还能立体选择性地实现含羧酸药物分子和天然产物的后期胺化。相关成果发表于
Nature Chemistry
上。
图2. 对映选择性1,3-氮迁移的初步实验与优化。图片来源:
Nat. Chem.
首先,作者以氮上带有不同吸电子基团的羧酸衍生物
1a-e
为底物、“手性金属”钌配合物为催化剂对反应条件进行了探索(图2),其中不对称催化的手性源于具有 Λ 或 Δ 构型的钌立体中心(即左旋或右旋螺旋构型)。结果显示三氟乙酰基(
1a
)、甲苯磺酰基(Ts,
1b
)和甲磺酰基(Ms,
1c
)的反应效果较差甚至不反应,而甲氧羰基(
1d
)和2,2,2-三氯乙氧基羰基(Troc,
1e
)则能以优异的收率和对映选择性获得相应的手性氨基酸(
R
)-
2d
和(
R
)-
2e
,其中底物
1e
的反应效果最佳,产率高达93%、ee值高达95%。进一步对催化剂、溶剂和碱进行筛选后,作者发现在Λ-
RuDMP
为催化剂、
CH
2
Cl
2
为溶剂和
K
2
CO
3
为碱的条件下,1,3-氮迁移的反应效果最佳。
图3. 钌催化底物拓展。图片来源:
Nat. Chem.
在最优条件下,作者对羧酸的底物范围进行了考察。一般而言,羧酸底物先与N-Troc 保护的羟胺在
N,N'
-二环己基碳二亚胺 (DCC) 或 1-乙基-3-(3-二甲基氨基丙基)碳二亚胺盐酸盐 (EDCI) 的作用下进行偶联,得到的氮杂酯在标准条件下进行重排便可得到所需的产物。如图3所示,不同基团取代的苯乙酸氮杂酯(
3-21
)、稠合芳环和杂芳环底物(
22-25
)甚至具有抗炎和镇痛作用的生物活性分子(
26、27
)均能兼容该反应,以中等至较好的产率和优异的对映选择性获得所需产物,特别是产物
23
还能以克级规模进行制备。此外,非苄基位底物如烯基(
28-32
)、(
E
)-3,5-己二烯酸(
33
)、炔基(
34-35
)同样也可以制备相应的手性α-氨基酸,尽管对映选择性有所降低。然而,未活化脂肪族亚甲基底物却只能以20%的产率获得相应的α-氨基酸(
36
),尽管具有优异的对映选择性(90% e.e.)。值得一提的是,当α-位带有甲基的外消旋底物
37
进行反应时,则以71%的产率和48%的对映选择性获得相应的α-氨基酸((
R
)-
38
)。由于底物
37
是存在手性的,因此作者推测催化剂会与对映异构体的 C-H 键之间存在立体区分。事实上,
S
-对映异构体(
S
)-
37
能以优异的产率和对映选择性合成α-氨基酸((
R
)-
38
);而(
R
)-
37
则反应缓慢,产率和对映选择性均很差((
S
)-
38
)。最后,作者选择
S
-对映体并将其置于标准条件下进行反应,以25-86%的产率和86-99% 的 e.e.值获得相应的α-二取代氨基酸(
39-42
)。总而言之,这些结果表明立体控制的1,3-氮迁移可适用于苄基、烯丙基和炔丙基 C-H键。
图4. 铁催化底物拓展。图片来源:
Nat. Chem.
受铁催化C-H键胺化反应中nitrenoid中间体的启发,作者将注意力转向更廉价、更绿色的铁催化。具体而言,以羧酸衍生物
1e
转化为 N-Troc 保护的苯甘氨酸
2e
作为模型反应(图4),对不同的手性铁络合物进行了筛选,结果显示(
R,R
)-
FeBIP
能以95% 的收率和91%的e.e.值获得相应的苯甘氨酸 (
S
)-
2e
。尽管该体系下苯基(
2e
)、烯丙基(
32
)和丙炔基(
34
)的反应效果不能与钌催化体系相媲美,但 (
R,R
)-
FeBIP
能够有效地实现伯(
43-50
)、仲(
51
)和叔(
36
)脂肪族侧链底物甚至复杂分子的C(
sp
3
)-H键胺化反应,如石胆酸(
52
)、消旋布洛芬(
53
),并以中等至良好的产率和选择性得到相应的α-氨基酸。
图5. 计算化学研究。图片来源:
Nat. Chem.
为了进一步探究反应机理,作者以
RuH
催化羧酸衍生物
1d
的模型反应进行了密度泛函理论计算(图5a),结果显示底物
1d
会逐步置换催化剂
RuH
中钌中心的两个不稳定乙腈配体,并以螯合配位模式获得中间体
II
。由于
II
中的酰胺 N-H 键被充分酸化,因此能被弱碱(如三甲胺)去质子化并得到相应的中间体
III
,后者经过渡态
TS-I
进行N-O 键裂解并产生钌氮宾中间体
IV
。尽管单线态氮宾配合物
1
IV
比三线态氮宾配合物
3
IV
更稳定,但 C-H 键裂解的过渡态
TS-II
在三线态下的
能量
较低(
3
TS-II
vs
1
TS-II
),此现象说明了Curtin–Hammett 原理的可能性,即后过渡金属钌的存在增强了快速单线态-三线态自旋交叉,随后从
3
IV
通过循环过渡态
3
T
S-II
优先发生氢原子转移(HAT)得到双自由基
3
V
。此外,作者还进行了动力学同位素实验(
k
H
/
k
D
= 2.9),这表明C-H键裂解产生自由基是反应的决速步,其与DFT计算三重态配合物发生HAT 步骤的能垒相一致。另一方面,在烯丙基 C-H 键胺化反应中观察到的
Z
→
E
烯烃异构化也支持自由基机制。
随后,作者还对1,3-氮转移过程中立体控制的起源进行了探究。如图5b所示,非共价键相互作用图表明主产物对映异构体
3
TS-II-major-Ph
的过渡态是通过催化剂的吡啶配体与底物上苯基取代基之间的π-π 堆积相互作用来稳定的,而π-π 堆积在次要过渡态
3
T
S-II-minor-Ph
中并不存在,并且能量比
3
TS-II-major-Ph
高1.5 kcal m
ol
-1
。另外,对两种过渡态进行的畸变相互作用分析进一步支持了稳定相互作用(如π-π 堆积)有助于产物
2d
的立体选择性(图5c)。值得一提的是,DFT计算结果还证明在没有π-π 堆积相互作用的情况下也可以实现立体区分,例如:带有叔丁基的底物其因空间效应作用,导致主要产物对映异构体
3
TS-II-major-
t
B
u
比
3
T
S-II-minor-
t
B
u
更有利,这一结果与实验数值高度吻合。
图6. 反应机理。图片来源:
Nat. Chem.
基于上述控制实验和DFT计算,作者提出了可能的反应机理(图6):首先,氮杂酯底物在去质子化后通过N-O键裂解活化生成中间体
A
(对应于图5a 中的中间体
IV
),后者经立体控制 的HAT过程产生双自由基
B
(对应于图5a 中的中间体
V
),然后快速自由基重组以产生螯合物
C
(对应于图5a 中的中间体
VI
),最后羧酸盐的质子化诱导产物解离并结束催化循环。从整体来看,N-O 键断裂和随后的逐步 C-H 键插入实现了不对称的 1,3-氮迁移,从而合成手性 α-氨基酸。
总结
本文作者以前人从未报道的立体选择性控制1,3-氮迁移策略,成功地构建了一系列具有芳基、烯丙基、炔丙基(钌催化)和非活化烷基(铁催化)侧链的光学活性 α-氨基酸,同时还能对含羧酸药物和天然产物进行立体控制的后期胺化,为α-氨基酸的催化不对称合成提供了新方法。毫无疑问,该策略将加速非天然 α-氨基酸(拟肽药物的重要组成部分)的合成,并对具有调节特性的工程蛋白质以及酶的合成同样具有重要的意义。
原文(扫描或长按二维码,识别后直达原文页面):
Stereocontrolled 1,3-nitrog
en migration to access chiral α-amino acids
Chen-Xi Ye, Xiang Shen, Shuming Chen, Eric Meggers
Nat. Chem
.,
2022
, DOI: 10.1038/s41557-022-00895-3
(本文由
吡哆醛
供稿)
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