金关工程（二期）加工贸易管理系统详解
保税核注清单操作指南及业务流程解析
金关工程（二期）是经国务院批准的“十二五”期间国家重大电子政务项目，已于2018年2月正式上线运行。该工程为海关深化加工贸易与保税监管改革提供技术支撑，全面支持国家“一带一路”、跨境新政和全国一体化通关改革等战略实施。
其中，加工贸易管理系统作为核心组成部分，涵盖特殊区域管理、加工贸易账册管理、手册管理及保税物流管理等多个子系统。企业根据所属类型使用相应系统：特殊监管区域内企业使用特殊区域管理系统；保税物流中心及两仓企业使用保税物流管理系统；区外加工贸易企业则使用账册或手册管理系统。
系统四大亮点
- 整合底账类型，统一底账结构：实现底账标准化管理，提升数据一致性。
- 全面支持料号级数据：贴近企业实际管理模式，支持精细化核算。
- 创设保税核注清单：作为保税底账核增核减的专用单证，取代报关单直接核注功能，法律地位相当于报关随附单证。
- 全面无纸化、智能化管理：简化流转手续，降低企业运营成本。
保税核注清单的核心作用
保税核注清单是金关二期保税底账进、出、转、存的唯一凭证。设立金关二期账册的企业，其保税底账变动不再依赖报关单直接核注，实现企业料号级管理、通关项号级申报。同时，以下情形可免于报关单申报：
- 加工贸易余料结转
- 货物销毁（未获收入）
- 不作价设备结转
- 特殊监管区域与区外企业间进出货物
此举显著减少报关频次，节约合规成本。
保税货物流转操作流程
根据海关总署2018年第52号公告，特殊区域、保税物流中心（B型）企业间流转按“先报进、后报出”原则操作：
- 转入、转出企业分别申报进口、出口核注清单；
- 区外企业申报对应报关单（申报地为区域对应关区代码）；
- 核注清单审核通过后，企业自行运输并办理卡口核放手续。
相比传统转关模式，有效降低报关与物流成本，提升通关效率。
保税核注清单修撤规则
企业需修改或撤销核注清单时，应遵循以下规定：
- 若对应报关单（备案清单）需撤销，其核注清单须一并撤销，系统自动联动删除。
- 无需或尚未申报报关单的核注清单，仅可申请撤销。
- 报关单修改涉及核注清单内容的，须先修改清单，确保数据一致。
- 修改项目涉及已备案保税底账数据的，须先变更底账。
- 保税底账已核销的，核注清单不得修改或撤销。
海关布控复核期间，相关清单在办结手续前不得修改或撤销。
申报颗粒度对比：金二系统 vs H2010系统
金关二期系统支持料号级申报，企业在设立保税底账及申报核注清单时可直接使用料号级数据，无需归并压缩。报关单数据由核注清单归并生成，实现关企管理颗粒度统一，提升数据匹配度与管理精度。
分送集报业务办理流程
- 企业向海关申报业务申报表；
- 办理出区业务需提交担保；
- 每次实际分送时申报出入库单；
- 卡口通行前申报核放单；
- 规定时间内集中申报集报核注清单与报关单；
- 完成商品数量平衡核销后申请业务结案。
“先入区、后报关”操作模式
符合条件的企业可通过跨境快速通关、区港调拨、舱单分拨等方式将货物调拨入区，入区环节无需申报核放单。货物入区理货后，在规定时间内通过金关二期系统申报：
- 区港联动类型核注清单（无需过卡）
- 进境备案清单（或报关单）
待报关单证放行结关后，系统自动联动核注保税底账。
区内企业货物状态分类监管申报
保税与非保税货物互转时：
- 保税企业按二线进出区模式申报保税核注清单及报关单；
- 非保税企业通过辅助系统申报非保货物进出申报单；
- 保税企业向主管海关申请人工卡口放行。
区外非金二账册企业进出特殊区域申报
当区外非金二账册企业与区内企业均需申报时：
- 区内企业先申报保税核注清单；
- 报关单类型选择“进/出境两单一审备案清单”（不可选原“备案清单”）；
- 手账册备案号填写“NULL00000000”；
- 生成备案清单，区外企业同步申报“两单一审”报关单并与备案清单关联。
保税区内企业国内购料入区申报
- 申报进口保税核注清单（监管方式5000，运输方式9，报关类型选“关联报关”）；
- 以区内企业为境内发货人申报出口报关单（监管方式0110，运输方式0）；
- 与核注清单关联；
- 货物过卡后触发报关单结关及核注清单底账核注。
查验异常情况下同批次货物先行放行
查验发现异常时，允许对同批次中未见异常货物先行放行：
- 企业向现场海关申请删除原核放单；
- 重新申报未异常部分的核放单并过闸放行。
对于双卡口查验模式（卡口间查验）：
- 删除原核放单；
- 重新申报核放单并人工过一闸；
- 运输工具自行过二闸离场。