根据《中华人民共和国知识产权海关保护条例》，知识产权海关保护是指海关对与进出口货物相关的商标专用权、著作权及有关权利、专利权等依法实施的保护措施。

企业申请知识产权海关保护备案，需通过“知识产权海关保护备案申请系统”在线办理。具体流程如下：

一、注册系统用户

备案申请人须以知识产权权利人名义，在“知识产权海关保护备案申请系统”（网址：http://202.127.48.148/）注册账号，填写基本信息，获取系统登录权限。

二、提交备案申请

登录系统后，在“申请新备案”页面填写知识产权信息及相关内容，并上传PDF格式的证明文件及JPG或BMP格式的清晰图片附件。申请书应包含以下内容：

• 权利人名称、注册地或国籍；
• 知识产权名称、内容及相关信息；
• 知识产权许可使用情况；
• 合法使用该知识产权的货物名称、产地、进出口商、主要特征、价格及进出境海关；
• 已知侵权货物的制造商、进出口商、主要特征、价格及进出境海关。

所有信息确认无误后提交，即完成申请。

三、查询审核结果

提交申请后，可随时登录系统查看审核进度。海关总署将在收到电子申请之日起30个工作日内作出核准或驳回决定，并通过电子邮件通知申请人。

四、缴纳备案费用

备案费需通过银行转账或电汇方式汇至海关总署账户，金额须为800元的整数倍。汇款时务必在备注栏注明权利授权号或备案申请编号。

五、确认缴费信息

海关总署财务部门将根据银行流水核对汇款信息。确认到账后，用户账户余额将相应增加。

六、备案生效

当申请通过审核且账户余额不低于800元时，备案自动生效，系统将通过电子邮件通知申请人。