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TissueGnostics“丁香园网站”应用专题—助力神经领域定量研究

TissueGnostics“丁香园网站”应用专题—助力神经领域定量研究 TissueGnostics
2019-12-16
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导读:神经科学已成为最前沿的科学研究领域,科学家用现代实验技术的方法从不同角度、不同层次开展对脑认知的研究。

助力神经领域定量研究

       神经科学已成为前沿的科学研究领域,科学家用现代实验技术的方法从不同角度、不同层次开展对脑认知的研究。神经元结构识别,常见的解决方案是针对细胞体和神经突进行特异性染色,再根据不同染色区分不同的细胞结构,这样往往也会造成样本在制备过程中操作复杂,多重染色也会造成非特异性染色增多,增加定量分析的难度。

       TissueGnostics 公司提供的特异性神经元量化分析方案,利用形态学识别的方法,可以在多种不同样本类型(HE,IHC,IF 等)中,识别出神经元胞体和突起,良好解决了上述问题。按照不同功能、不同区域的神经元外型的差异,在免疫组化样本中,对细胞体和神经突的大小、长度、分支数量进行识别定量,并根据不同功能与不同区域,区分单极/多级神经元。还可以通过对神经元胞体及神经突起的空间位置信息,使不同神经元突起之间,接触数量的识别与定量分析成为可能。


大咖视角


Beatrice Knudsen, M.D., Ph.D.

Professor of Biomedical Sciences and Pathology, Scientific Director of Translational Research core, Cedars-Sinai Medical Center, Los Angeles, USA
美国洛杉矶 Cedars-Sinai 医学中心生物医学与病理学教授,转化研究核心科学总监)
"The TG system provides the highest quality images of tissues in immuno-oncology project that are stained in a multiplex format. With the TG StrataQuest software we can extract unique data from the images and test for correlation with response to immunotherapeutic. Therefore, the TG system is ideally suited for translational research questions to develop novel drug response biomarkers and for analysis of tissues in immunotherapy clinical trials."

Scott J. Rodig, M.D. Ph.D.

Associate Professor of Pathology, Harvard Medical School, Tissue Microarray and Imaging Core Facility, Harvard, USA
(美国哈佛医学院组织微阵列和成像核心设施病理学副教授)

"Taken together, we find that the TissueGnostics system provides superior cellular biomarker quantitation within the context of the existing tissue histology for both traditionally stained tissue sections (single, color IHC analyzed by brightfield) and tissue section stained by multiparametric immunofluorescence."

Prof. Dr. Uwe Ritter

Institute for Immunology, University of Regensburg(雷根斯堡大学免疫学研究所)

"We are working with the TissueFAXS I plus system to quantify distinct cell populations in situ. Based on our experience we can strongly recommend that technique. The advantages are: automated image acquisition; software based data analysis and 3 color phenotyping of cell subsets in situ. "

Yu Yang, M.D

Director of Histomorphology Platform, Research Center of Shanghai Public Health Clinical, Center Affiliated to Fudan University

上海市公共卫生临床研究中心复旦大学附属中心组织形态学平台主任)

"TissueFAXS 200 Plus was installed in our center in August 2015, but I got to know and experienced TissueGnostics systems more than three years ago. Since entering the Chinese market, TissueGnostics always has focused on the customers experience. Its software comes with many user-friendly features and is improved very quickly. TissueFAXS 200 Plus provides high quality images and the patented analysis software for cell identification has high reliability, which greatly improved our research quality in histomorphology. I am really looking forward to the TissueFAXS SL PLUS Confocal upgrade with 3D reconstruction software. I believe that this will bring us more surprises."


案例分享   案例 1. 神经胶质细胞

       神经胶质细胞的活化状态,是评价中枢神经系统功能的重要指标。如在神经性疾病当中,小胶质细胞会释放细胞因子和趋化因子,参与炎性反应,改变脑组织细胞微环境结构与功能。如何客观有效评价神经胶质细胞的活化状态,一般来说会参考细胞大小形态及其神经突起长度数量等参数。

       TissueFAXS Cytometry 技术首先根据 Z-stack 多层扫描图像获得三维神经结构在二维水平的投影细胞核识别算法,区分边缘锐利的当前焦面细胞核及边缘模糊的焦外杂质或大小不等的细胞碎片,继而可以在组织原位从形态学上区别突起与神经元胞体的边界,对不同长度的突起数量以及神经元胞体大小进行统计分析,获得准确的定量分析数据。


案例分享   案例 2. 神经退行性疾病

       神经退行性疾病,又称神经退化障碍(Neurodegenerative Disease),是一类以大脑和脊髓的细胞神经元逐渐退化死亡所直接导致的疾病,影响人类的运动感知与记忆认知相关功能。由于啮齿类实验动物模型并不足以完全模拟人类神经退行性疾病的病理生理机制,借助灵长类实验动物进行大尺寸样本的全景分析就成为一种必然的选择。TissueFAXS Cytometry 具有的超大尺寸玻片高倍油镜全景获取技术,可以保留超大脑片中光学极限分辨率下的所有细节,构建虚拟玻片,并对其微小的结构,如 Aβ斑块,进行不同脑区的数字化分析,获得准确客观的量化数据。


案例分享   案例 3. 神经突触的长度与数量关系

      神经突触的长度与数量关系定量,是神经科学领域经久不衰的话题之一。除了常见的分析需求,借助于电子计算机,在更进一步的科学研究中,还需要对神经突触的分支数量与分级程度进行识别与量化。TissueFAXS Cytometry 定量分析技术除了满足上述所有定量分析内容之外,还可以在光学分辨率水平,识别不同神经细胞发起的不同神经纤维中,互相交联纤维的数量关系。结合 TissueFAXS Cytometry 在全景尺度下的细胞核/质/突触的大数据空间分布分析等功能,提供在神经细胞爬片、脑组织切片中,神经细胞发育情况,神经疾病发展转归,信号通路传递影响等方面的更多更准确的研究数据。


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TissueGnostics
TissueFAXS Cytometry 技术为用户提供了从影像到分析的全方位解决方案, 解决了图像数据,特别组织图像难以准确定量和可信度低的痛点。
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