
DrugFlow上线以来,我们经常接到小伙伴的咨询,说DrugFlow虽然很不错,但我不是这个专业的或者我们这里没有做计算的同学,问我们可以直接提供哪些计算服务,可不可以直接把活儿干了
针对先导分子发现与优化这一在小分子药物研发中最具挑战性的环节,碳硅智慧可提供包括分子对接、成药性预测、分子动力学模拟、结合自由能计算、虚拟筛选、智能分子设计与优化等在内的多项计算服务,助力用户提升研发效率。今天就为大家详细介绍下我们可以提供哪些具体的计算服务。非常适合药企、科研院所、医院,或者正在为课题里计算的事情挠头的你。
1.分子对接
分子对接用于快速预测配体小分子与靶标蛋白之间的结合模式及结合强度,进而指导虚拟筛选、先导分子优化、靶标选择性分析等多个下游任务。碳硅智慧自研的AI对接算法KarmaDock和CarsiDock,可提供高通量和高精度的分子对接计算。

2.成药性预测
候选分子的成药性对整个新药开发具有非常重要的意义,在药物研发早期开展化合物吸收、分布、代谢、排泄和毒性(ADMET)的预测评估有助于及早排除成药性不好的分子,进而有效降低临床阶段实验失败的风险。依托自主研发的DrugFlow软件平台,碳硅智慧目前支持对76种物化性质、5种药化性质、21种成药性参数、27种毒性性质的系统性评价。

3.分子动力学模拟
分子动力学模拟可以得到体系原子的运动轨迹,能够在原子水平理解生物大分子的运动与生物功能,阐明蛋白-小分子之间相互作用机理。碳硅智慧可提供包括常规分子动力学模拟、元动力学、伞形采样在内的多种分子动力学模拟服务,从多尺度阐明靶标-配体识别作用机制。

4.结合自由能计算
基于分子动力学模拟所产生的大量构象, 通过结合自由能计算可进一步分析配体和与靶标之间的结合亲和力。碳硅智慧不仅支持MM/PBSA、MM/GBSA等两点式结合自由能计算方法,同时还支持FEP等炼金术自由能计算方法,以有效支持先导分子优化,分析配体与靶标之间的相互作用。

5.虚拟筛选
虚拟筛选主要用于苗头及先导分子的发现。结合碳硅智慧自研的ADMET预测系统、新型AI对接及重打分方法、M模拟及结合自由能计算方法以及药物化学专家知识,构建层级式虚拟筛选流程,进而从数亿级数据库中挖掘潜在的活性分子。

6.智能分子设计与优化
依托碳硅之后自主研发的智能分子生成及优化模型、高性能分子对接算法以及高精度亲和力预测方法,为先导分子发现和优化提供了一整套成熟的解决方案。

如果大家有计算服务的需求,可以直接发送邮件到 service@carbonsilicon.ai,可以有优惠哦!
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