艾必赛知识问答第五期
样本裂解与定量指南
前言
在蛋白表达研究中,无论是Western blot、免疫沉淀(IP)还是质谱分析,样本处理都是影响结果准确性的第一道关口。从裂解方法的选择、抑制剂的添加,到后续的蛋白定量手段,每一步都需要精准把控,才能为后续的信号检测与数据解读打下坚实基础。
为什么蛋白裂解这么重要?
不同细胞或组织的结构差异显著,蛋白质定位也各不相同。细胞膜、核膜、胞器膜等结构对蛋白提取形成天然屏障,若裂解方法选择不当,不仅提取效率低,蛋白降解与变性风险也大大增加。特别是在研究膜蛋白、磷酸化蛋白或瞬时信号激活等课题时,对样本完整性的要求更为严苛。
Fig.1.样本裂解过程示意图
(doi.org/10.3390/mi8030083)
经典RIPA裂解液配方与操作建议有哪些
RIPA(Radio Immunoprecipitation Assay)裂解液因其兼具裂解力与蛋白保留能力,在总蛋白提取场景中应用广泛。适用于细胞裂解、组织匀浆样本的常规Western blot、免疫共沉淀(IP)及部分功能性蛋白分析。
常规RIPA裂解液配方
|
成分 |
浓度 |
|
Tris-HCl(pH 7.4–7.6) |
50 mM |
|
NaCl |
150 mM |
|
NP-40 或 Triton X-100 |
1% |
|
Sodium deoxycholate |
0.88% |
|
SDS |
0.10% |
使用前需现配添加以下抑制剂以提升裂解效果和蛋白稳定性:
1 mM PMSF(抑制丝氨酸蛋白酶)
1 mM EDTA(螯合金属酶活性)
蛋白酶抑制剂混合物(如E64、pepstatin A)
磷酸酶抑制剂:NaF、Na₃VO₄(如需保护磷酸化位点)
Fig.2.RIPA裂解液组分图
裂解操作注意事项有哪些?
|
操作阶段 |
建议说明 |
|
裂解前 |
样本需预冷,器材提前冰浴预冷;保持裂解液新鲜现配 |
|
裂解中 |
操作全程冰上,防止蛋白酶激活降解目标蛋白 |
|
裂解后 |
高速离心(如12,000 rpm, 10 分钟, 4°C),取上清,尽快进行定量和上样 |
|
特殊样本 |
对于膜蛋白、核蛋白、线粒体蛋白,建议选用专用裂解液并根据目标定位调整方案 |
蛋白定量方法简述:BCA vs Bradford
在蛋白裂解完成后,准确定量是保证上样一致性与后续分析可靠性的关键一步。以下为常用蛋白浓度检测方法对比:
|
方法 |
原理 |
优势 |
注意事项 |
|
BCA 法 |
铜离子还原 + Bicinchoninic Acid 络合反应,在562 nm处显色 |
抗干扰性强,适配多种裂解液,结果稳定 |
对还原剂、螯合剂部分敏感,需控制浓度 |
|
Bradford 法 |
染料与蛋白结合,引起波长迁移 |
快速、灵敏、操作简便 |
对SDS等干扰敏感,适用性较窄 |
Fig.3.蛋白定量方法选择图(10.1039/C4AN01819B)
典型错误示例与优化建议有哪些
|
问题表现 |
原因分析 |
优化方案 |
|
样本条带模糊、拉丝 |
裂解不充分、蛋白降解 |
延长裂解时间,添加抑制剂并全程冰浴操作 |
|
上样量差异大、结果不一致 |
未定量或浓度偏差大 |
统一BCA定量方法,建议重复两次检测取平均 |
|
膜蛋白检测信号弱 |
RIPA裂解力不足 |
替换为Triton X-100高浓度裂解液或膜蛋白专用Buffer |
Fig.4.裂解失败案例
结语
蛋白表达实验成败的第一步,始于样本裂解和定量环节。标准化的裂解流程与合理的Buffer选择,不仅能提升目标蛋白保留率,也为后续抗体检测与数据分析奠定基础。建议实验者根据研究目的灵活调整裂解策略,结合定量方法双重把关,共同守好蛋白分析的“入口关”。abinScience提供高品抗体产品,支持您的实验需求。
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