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科研绘图 | GO富集结果柱形图绘制

科研绘图 | GO富集结果柱形图绘制 爱基百客生物
2023-01-04
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导读:用R语言的ggplot2包来画一张GO富集结果的柱形图。

当我们拿到GO结果的时候,常常有用柱形图表示的分析结果。有些小伙伴就好奇这些柱形图到底是怎么画出来的。本期我们就用R语言中的ggplot2包来画一张GO富集结果的柱形图。

 数据格式 

GO分析后我们往往会得到以上的表格,而GO柱形图用到的数据仅有几列。以上面数据为例,这是一个蛋白组和转录组联合分析的结果,我们需要用到的数据是第2和6-8列。横坐标为GO条目,纵坐标为P的-log10的值,不同的本体用分面的形式分开。

◆ 脚本代码 

◆ 生成的图片 

生成图片后,x轴的标签有很多文字重叠,可以通过更改图片尺寸,文字大小和文字角度来解决。
脚本代码下载链接:
链接:https://pan.baidu.com/s/1PDCD3kjnTEYM5VAsnGgfjQ?pwd=mcb7
提取码:mcb7

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【声明】内容源于网络
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爱基百客生物
爱基百客是一家专业提供表观组学、单细胞与空间组学以及高通量测序分析的新型生物科技服务企业,旗下拥有DNBSEQ-T7、10xGenomics等平台,依托表观技术的优势,为生命科学研究和医疗健康等领域提供方案设计到数据分析一站式服务。
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