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云平台 | 零代码绘制桑基图

云平台 | 零代码绘制桑基图 爱基百客生物
2025-09-17
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爱基百客云平台关系网络可视化之桑基图
1. 云平台小工具使用
  • 1.1 云平台关系网络可视化之桑基图
  • 1.2 参数设置
  • 1.3 任务查看
  • 1.4  结果

    1.4.1 图片格式

    1.4.2 交互网页格式


     1  
    爱基百客云平台小工具使用

    首先,打开爱基百客官网:http://www.igenebook.com;点击菜单栏最右侧“云平台”按钮。

    弹出云平台界面(下图),输入账号、密码和验证码方可登录;进入云平台,可以轻松实现多种组学数据的分析和可视化,实现真正的“零代码、无门槛、操作简单”!

    登陆后,如下图,我们进入到小工具专栏。当前云平台已上线了33款小工具供大家使用,包括基础绘图、高级绘图、差异检验、聚类分析和序列处理等子模块,本着用户至上的理念,平台小工具将会持续更新维护,积极接受用户的反馈和意见。


    1.1 
    云平台关系网络可视化之桑基图

    关系网络图(也称为节点链接图)常用于显示事物之间通过链接形成的网络关系。其主要组成元素包括节点和边。可通过节点的颜色大小和形状反映某一事物的属性,而边的粗细和颜色则反应网络中的互作关系强度、类型等。桑基图可算得上关系网络图的一个变种。

    桑基图也是通过节点和连线(流)反映事物的动态变化趋势和特征。桑基图(Sankey diagram)具有以下几个特点:

    • 直观表达流量:桑基图通过宽度可视化显示了从一个状态到另一个状态的流动,使得观察者能够直观地理解流量的来源、去向和数量。

    • 多变量关系展示:桑基图可以同时展示多个变量之间的关系,例如不同类别、群组或因素之间的流动情况。这种多变量的可视化帮助我们发现模式、趋势和连接性。

    • 层次结构清晰:桑基图可以用于展示层次结构中元素之间的流动,例如组织结构中的成员流动、能源系统中的能量流动等。这有助于理解复杂系统的组成和相互作用。

    在生物学富集分析中,桑基图能反映基因列表与富集到的功能术语(如GO、KEGG通路) 之间的多对多关系及其定量属性。

    下面我们进行桑基图可视化实操练习。

    首先点击小工具桑基图

    右侧的工具介绍对桑基图小工具的主要用途,使用方法以及结果解读做了详细的说明。 左侧是必要的输入文件和参数选项。任务名称和任务编号系统会自动生成。后面可用于记录查看具体的任务。 小工具提供了示例文件给用户做测试分析。同时,该页面还提供了一些常用参数调节选项。您也可进行自定义,后面将详细介绍。输出名自定义,默认Result。


    1.2 
    参数设置

    输入文件:支持txt(制表符分隔)文本文件,以及Excel专用的xlsx格式,同样支持旧版Excel的xls(Excel 97-2003 )格式。

    输入文件为包含source、target 以及互作统计值的表格。如下表所示:

    如果文件已经上传过,您可以直接点击选择按钮找到需要的文件勾选确定,无须再次上传。输出名默认是result。

    填写好上述所有的参数后,一键提交即可。


    1.3 
    任务查看

    您可在任务管理栏中查看任务的运行情况和结果。默认情况下新任务将会在最上方展示。也可通过任务名、任务编码、日期点击查询,找到需要的任务。 如下图:当状态成功时,表示任务成功结束。

    点击下载按钮可直接打包下载全部结果。点击查看按钮可在线查看结果。

    您可在在线查看结果后选择是否下载保存。另外如果结果较多时,结果展示区还可通过点击左侧或右侧的箭头进行图片切换。您可挑选自己感兴趣的结果图片进行下载保存。


    1.4 
    结果

    输出结果包含交互式可调整动态html文件和pdf格式以及png格式的桑基图。

    1.4.1 图片格式

    1.4.2 交互式网页格式

    可随鼠标选定,展示具体数据等操作。
    IGENEBOOK
     关于我们 

    武汉爱基百客生物科技有限公司(简称:爱基百客,IGENEBOOK)是一家专注于表观组学、单细胞时空组学和高通量测序分析服务的新型生物科技企业。公司办公面积逾3000m2,员工已达到百余人,业务覆盖全国,核心团队来自国内知名高校和基因测序公司。公司先后引入ChIP、ATAC-seq、CUT&Tag、单细胞(进口、国产多平台)、DNBSEQ-T7和STOmics时空组学等实验平台,同时配备MGISP-960和AlphaTool等自动化设备。

    运营至今合作科研客户超5000家,涵盖国内知名科研院所、高校及相关企业。多项合作成果发表在Science、Cancer Cell、Circulation、Nature CommunicationsPlant Cell等国际顶级期刊,广受客户好评,成为国内成长最迅速的高通量测序科研服务企业之一。爱基百客将秉承服务至上的理念,发挥自身优势,期待与海内外科研学者精诚合作,共探生命百科全书。
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    爱基百客生物
    爱基百客是一家专业提供表观组学、单细胞与空间组学以及高通量测序分析的新型生物科技服务企业,旗下拥有DNBSEQ-T7、10xGenomics等平台,依托表观技术的优势,为生命科学研究和医疗健康等领域提供方案设计到数据分析一站式服务。
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    爱基百客生物 爱基百客是一家专业提供表观组学、单细胞与空间组学以及高通量测序分析的新型生物科技服务企业,旗下拥有DNBSEQ-T7、10xGenomics等平台,依托表观技术的优势,为生命科学研究和医疗健康等领域提供方案设计到数据分析一站式服务。
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