蛋白酶体是催化蛋白酶的大的多亚基，负责大部分细胞质和核蛋白降解，并且它们的结构和功能在真核生物中是保守的。蛋白酶体最初被鉴定为泛素依赖性蛋白水解途径的蛋白水解模块。
自噬是真核生物中主要的细胞降解途径。研究揭示了自噬在植物生命的许多方面的重要性，包括幼苗建立，植物发育，抗逆性，新陈代谢和繁殖。这证明了自噬在恶劣环境条件下进行大量降解的双重能力，同时高度选择性地靶向特定区域和蛋白质复合物以调节关键的细胞过程，即使在有利的生长条件下也是如此。细胞成分被输送到液泡中使其能够循环利用，尤其是在压力下影响植物代谢组。
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