
在之前的文章中,我们复盘了m6A甲基化疑难杂症&治疗方法。

试剂盒原理
P-9005使用独家配方试剂使RNA被高效的结合吸附在微孔板上。使用特异性捕获 N6-甲基腺苷抗体和检测抗体检测 N6-甲基腺苷 (m6A)。检测到的信号得到增强,然后通过读取微孔板分光光度计中 450 nm 波长的吸光度进行比色定量。m6A 的量与测得的 OD 强度成正比。
P-9005-中文说明书链接:
https://www.amyjet.com/featured/m6A%20RNA-kit-7.shtml
常见问题解答
一
实验样品类
01
试剂盒样品有没有种属限制?
P-9005试剂盒没有种属限制,但是需要是提取好的RNA样品。
RNA样品纯度要求和输入量?
RNA纯度要求:A260/280>1.9;A260/230>1.7。无DNA污染;另外RNA序列长度大于80nts,以便RNA可以较好的结合在板上。
RNA输入量:对于每次实验RNA的输入量是100-300ng。最为理想的RNA的输入量应该是200ng,正如我们所知m6A通常不到总RNA的0.1%。
二
试剂盒类
有效期是多久?
客户收到货后,有效期6个月。
P-9005试剂盒里的组分是否可单独购买?
可以单独购买,但是建议客户购买完整试剂盒。
在Date Sheet中,它没有告诉我们应该使用什么样的材料来避免RNase,RNase是否会影响这个试剂盒的结果?
实验中涉及到的试剂都是不含RNase的,而且当RNA结合在板上后,RNase将不会再影响实验结果。
客户的缓冲液是50mM的PH8的tris-盐酸缓冲液,可以用这个缓冲液分装吗?
尽量推荐使用与厂家相同配方的溶液进行分装。其他溶度的缓冲液是否可用,需要客户自行尝试。
三
产品说明书类
试剂盒孔板数指的是可以检测的样品数量吗?
48/96孔试剂盒只能做48/96个test,而不是48/96个样品。相应的试剂会比48孔稍微多一点,因为要考虑到加样损耗的因素。
加样时RNA样品体积多少合适?
在与RNA的结合过程中,建议的200ngRNA的样本量体积在1-8uL,这样才能保证最佳的结合效率。
抗体稀释比例是多少?
CA和DA的原始浓度都是1000X,但是稀释倍数不同,CA按照1:1000稀释,DA按照1:2000稀释,加大DA的稀释比例降低背景信号。
P-9005做m6A甲基化的话,为什么要用带滤芯的枪头?还有在第4步,m6A RNA捕获时,洗涤的操作溶液是直接用枪头吸掉呢,还是可以直接倒掉?
这里使用带滤芯枪头,目的是最大限度避免移液器带来的交叉污染。如果客户操作无误,用普通枪头也是可以的;使用手动移液器代替典型的板轻拂/倾倒方法,以确保完全去除缓冲液并最大程度减少孔间污染。注意,将移液枪沿孔的一侧慢慢向底部引导,避免刮擦到孔底表面。
加入80ul的结合液后,再加入RNA,孵育90min后,将BS移除,这时候RNA在哪?
RNA被高效RNA结合液结合在孔板底表面。八联管孔底表面有预涂处理,带正电,RNA的磷酸骨架带负电,在BS结合液(Binding Solution)的作用下,带负电的RNA可以稳定的结合在板上。
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