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是时候建立一个统一所有学科的预印本库了

是时候建立一个统一所有学科的预印本库了 学术头条
2017-02-13
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导读:生物学家正在筹办一个统一的预印本库网站,未来还将与物理学等学科联合起来。

生命科学家热衷于在同行评审之前在网上将他们的发现进行共享。而物理学家倾向于把论文传到一个资源库中,即“预印本”服务器arXiv上 。生命科学的预印本服务器正在快速增长。其中包括专门关注生物学的bioRxiv,以及arXiv的生物学版块。但在过去的一年里,已经陆续出现了其他同类网站,或者很快就会出现。这些网站也为生命科学的发展提供了机会:如面向化学的ChemRxiv,面向心理学的psyArXiv,甚至面向农业科学的AgriXiv和面向古生物学的paleorXiv。


现在,一个由生物医学研究资助者和科学家组成的联合机构正在着力打造 “一站式”的生命科学预印本服务。支持者认为这一举措可以理清混乱的局面,便于在预印本文献中挖掘新知识。 2月13日,由支持预印本的生物学家组成的一个草根组织ASAPbio发起了一次募资,以建立一个中央预印本网站。美国国立卫生研究院(NIH)、惠康基金会和其他一些一流的研究资助机构宣布支持这一概念。


位于伦敦的惠康基金会的数字服务主管罗伯特·凯利(Robert Kiley)说:“这类服务可能会很快走向碎片化。虽然生命科学的内容分布广泛,我们还是想要设法确保能将所有这些内容集中在一个地方。”。


关于这一服务的详情尚不得而知。ASAPbio的主管杰西卡·波尔卡(Jessica Polka)说。其服务范围将取决于具体的科学领域和资助机构。但是,除了聚合来自其他面向生物学的预印本网站的内容,ASAPbio还希望将该网站与arXiv和ChemRxiv网络相连,ChemRxiv是美国化学学会即将推出的预印本网站。


您的预印本都在这里了


支持者希望,提供一个提供预印本的中心网站,会使生物学家像物理学家一样全心全意地支持上传预印本的行为。物理学论文稿常常在同行评议期刊上发表前几个月就出现在arXiv.org上,因为研究人员要抢在竞争对手之前将自己的发现发表在网上。发布论文预印本的时间现在成为确定新发现的优先级、获得研究经费和职位的标准。 ArXiv每年处理超过10万份物理、数学和计算机科学的论文稿。(最大的生命科学预印本服务器bioRxiv在2016年约处理了5000份论文稿)。


康奈尔大学的理论物理学家保罗·金斯帕(Paul Ginsparg)表示,可以从arXiv学习的经验之一是用户更喜欢“一站式购物”,金斯帕在1991年创办了arXiv。他应该认为面向生命科学的预印本聚合网站也是如此,只要这些网站可以遵循统一的技术标准。


加州大学旧金山分校的细胞生物学家、ASAPbio的创始人罗恩·威尔(Ron Vale)表示,预印本中央服务也可以帮助科学家使用自动化软件从文献中获取知识。目前,想要对同行评议论文进行信息挖掘的研究人员面临着无数障碍,如出版商版权问题、文章分布在不同网站导致分散很难批量下载等。“我们试图将预印本论文视为数据,”Vale说。从技术上和法律上看,由计算机在中央站点上集中抓取论文预印本都是一种直截了当的方式,这些论文将以开放访问许可存在于中央站点上。


波尔卡不愿透露ASAPbio估计该网站需要多少成本,但arXiv的运营经费每年总计约92.5万美元,这笔钱由全球200多家研究机构和资助机构组成的集团支付;其中大笔捐赠来自西蒙斯基金会,这是一家位于纽约市的私人组织。金斯帕表示,在每年发表几万篇论文的情况下,生命科学网站的花销应该在5美元/篇左右。支持该网站的资助方尚未承诺支付这笔费用,但凯利希望资助者在详细信息发布后可以支付这些花销。


已经表示支持预印本中央服务的其他资助机构包括英国医学研究委员会(UK Medical Research Council),霍华德·休斯医学研究所(HHMI),加拿大健康研究所和欧洲研究理事会。 “这将向科学界发出一个强烈的信息,鼓励这种沟通。”Vale说。上个月,霍华德·休斯医学研究所宣布,将考虑把预印本论文作为决定是否与研究人员续签其久负盛名的五年期资助的标准之一。


文化挑战


《PeerJ》期刊的首席执行官杰森·霍伊特(Jason Hoyt)表示,他支持中央预印本网站,他的公司可能为创建这一网站添砖加瓦。但他表示,只有在大部分生命科学家都将预印本论文视作评价职业进步的标准时,网站才会获得成功。“目前困难是推翻生物学的固有思维。


ASAPbio和支持中央预印本服务的资助机构强调,它不能取代同行评议的期刊。他们注意到,发布在ArXiv上的大部分(在某些领域超过80%)论文最终发表在期刊上。 波尔卡表示:“我们真的认为这是对期刊体系的补充,不可能对期刊造成威胁。”他补充说,中央预印本服务不会组织同行评议。


位于伦敦的F1000Research提供期刊同行评议之前发布论文(但不考虑这些论文预印本)的服务,董事总经理丽贝卡·劳伦斯(Rebecca Lawrence)表示,这种做法无异于错失了一次机会。她希望通过中央预印本服务中加入同行评议,从而减少传统期刊对科学家职业的影响。 “这是一个向着正确方向一次了不起的转变,”劳伦斯说,“但我认为我们需要更进一步。


金斯帕最终设想出一个跨学科的“联合资源库”,聚合了来自arXiv和包括生命科学在内的其他领域的论文预印本。“25年前,我曾认为我们会比现在更接近实现这一点,不过目前我仍然认为,这个资源库的诞生是不可避免的。”他说。


原文链接:http://www.nature.com/news/heavyweight-funders-back-central-site-for-life-sciences-preprints-1.21466


【声明】内容源于网络
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