时间:2015/1/28(周四) 下午2:30 –4:00
报告人: 林伟昱 | 分子模拟、药物设计及化学信息学部 | 产品经理
内容简介:
MOE总部加拿大CCG公司于2015年12月21日正式发布了MOE最新版本2015.10。该版本的更新主要集中在针对蛋白模拟的用户界面的增强,以及计算机辅助分子设计的新的科学应用。MOE2015中包含以下主要特性:
蛋白-蛋白对接
− 用FFT产生对接的pose,并对所有原子进行能量最小化
− 定义受体和配体的位点进行对接
− 自动探测抗体CDR区域
将Alignment、Consensus和Superposition界面整合到了SequenceEditor中
− 使用分隔的并行的序列编辑窗格操作多聚体蛋白序列
− 使用树状图来显现两两比对的相似性,一致性和RMSD关系
− 使用可调节的序列编辑器基于标绘值选择残基
蛋白相互作用
− 生成一系列蛋白-蛋白界面的相互作用
− 对相互作用进行排序和筛选,以快速识别热点区域
− 观察相互作用,判定保守的相互作用
基于Domain的蛋白搜索
− 强化的模板空间用于同源模建
− 当全序列比对无法找到模板,可基于单独的Domain搜索合适的模板
分布式的药效团搜索
− 在集群上直接从MOE GUI进行药效团搜索
− 快速地执行公共数据库搜索
− 访问存储在中央服务器上的多个数据库
共价对接和电子密度对接
− 用基于反应的有机转化进行共价对接
− 使配体最大化地适应电子密度的同时,尽量降低其应力能
− 通过增强的,流线型的,基于场景的界面进行对接
拓展的Hückel描述符和pKa模型
− 计算分子属性,如logP,logS及摩尔折射率
− 确定在一个给定的pH值下配体质子化状态的种群
− 计算小分子的pKa和pKb
如何注册:
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电话: 021- 54975000
关于MOE
MOE是由加拿大CCG公司开发的功能全面、强大的分子模拟及药物设计综合软件,它是目前市场上最被广泛应用的一个软件包,世界排名前50的生物医药研发公司都在用这套软件系统;在科研领域每年引用这个软件发表的高水平文章多达七,八百篇。MOE集可视化、模拟和应用开发于一体,可以轻松、灵活地用于基于结构和基于片段的药物设计,药效团的发现和筛选,药物化学的应用,生物药的应用,蛋白和抗体的建模,分子建模和模拟,化学信息学和定量构效关系,以及定制化开发等等。
关于CloudScientific康昱盛
上海康昱盛信息科技有限公司是一家专门提供生物制药领域科学信息整体解决方案的公司。我们拥有一支一流的技术服务团队和资深的专家咨询团队,针对生物医药领域的各种公司、学术机构以及政府部门,提供从生物信息学、化学信息学、药物设计、毒性预测到临床前、临床的数据分析以及管理等一系列国际领先的科研软件产品、平台以及成熟的科学信息解决方案。
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