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让数据说话--新用户想了解Genevestigator分析功能,读这五个案例就可以了
那么什么才是组织特异性的基因？
也就是说，该类基因只在感兴趣的组织中特异性表达，其他组织并无此规律。
如果想要做到这一点，要调研所有的组织才能找到这样的基因。这对于普通的科研工作者来说，工作量是不可想象的。这个工作谁来做？Genevestigator。
接下来，我们以水稻为例，利用Genevestigator寻找在根部的特异性表达基因。
申请途径：http://www.cloudscientific.com/plus/list.php?tid=75
确保网络通畅！
首先，打开Genevestigator软件：
注意上图右侧的“Data Selection”，放大如下，点击“New”，即告诉Genevestigator软件，我们打算从哪个物种入手分析。
物种选择水稻，因此在Organism栏中选择“Oryza Sativa”。
选中后发现，Genevestigator收集了2527例昂飞表达谱芯片的数据。给批水稻数据集命名为：“OS_AFFY_RICE-1”
注：如果选择范围内的样本数量比较大，或许会需要等待几分钟的时间。
物种确定好了，接下来需要确定感兴趣的组织（根部）。怎么操作？
在主界面的右侧的“GENE SEARCH TOOLS”中选择“Anatomy”，即是我们告诉GENEVESTIGATOR，我们有感兴趣的组织，我们希望寻找组织特异性表达的基因。
放大如下：
点击之后，会出现如下：我们选择roots作为target（目标组织，感兴趣的组织）, 其他组织作为base（背景，需要排除的组织）
设定基因数量（10）， 点击“Run ”，出现下图结果。 找到的基因表达。可以看到，这些基因在根部确实有特异性的表达（深蓝色），而在其他部位为淡蓝色或者白色。
结果可以以excel的形式保存。图有PDF，GIF，JPG等格式。
目前Genevestigator收集了多少个物种的信息？
Tel: 021-54975000
E-mail: marketing@cloudscientific.com
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