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如何轻松批量提取专利文档中的图片类化学结构?

如何轻松批量提取专利文档中的图片类化学结构? 康昱盛
2021-09-27
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导读:Clide Professinal是一款备受好评的OSR工具,可以轻松、高效、准确、批量地识别和提取文献中的化学结构。

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药物研发人员在研发过程中经常需要阅读大量的文献和相关专利,并从中提取相应的化学结构信息。然而文献和专利中的化学结构通常以图片的形式显示,无法直接利用,不利于化学结构数据的整理和分析。目前的一些OCR(光学字符识别)/ OSR(光学结构识别)工具则可以帮助我们将图片中的化学结构转化成可编辑和直接使用的化学结构数据格式。Clide Professinal就是其中一款商业化多年,备受好评的OSR工具,其可以轻松、高效、准确、批量地识别和提取文献中的化学结构。

软件功能亮点

批量式图片结构识别

CLiDE的界面整体类似于Acrobat Reader。导入要提取结构的文献后其会显示整个文献的浏览视图,进行结构提取时则会在另一个平行视图展示提取出的结构,并且平行视图中结构的位置与原文档中的位置相对应,方便进行浏览。

另外,CLiDE既可以对单个图片结构进行提取也可以对特定的页数或者整篇文献进行批量结构提取。

高准确率

CLiDE能够自动修正原子符号,处理芳香环结构以及解析分子缩写基团。总体提取准确率高达87%以上。

结构修正

对于存在识别错误的结构,可以直接双击该结构打开编辑器进行实时的结构修正,同时支持MarvinSketch和ChemDraw两款主流结构编辑器。

多种结构文件格式导出

识别后的结构可以导出成多种常用的化学格式文件,如*.sdf/*.mol/*.cdx/*.mrv等,便于后续的使用。


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上海康昱盛信息科技有限公司是一家专门提供生物制药领域科学信息整体解决方案的公司。我们拥有一支专业的技术服务团队和资深的专家咨询团队,针对生物医药领域的各种公司、学术机构以及政府部门,提供从生物信息学、化学信息学、药物设计、毒性预测到临床前、临床的数据分析以及管理等一系列国际知名的科研软件产品、平台以及成熟的科学信息解决方案。




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生物医药领域信息解决方案供应商:分子模拟、药物设计、基因组学、蛋白组学、生物信号通路分析、电子实验记录本、信息管理系统
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