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你的交联肽段的ID是正确的吗？
使用最近发表的从已知的合成DSS交联肽库中获得的数据，我们评估了重要的交联匹配的真实FDR。搜库结果显示Cas9中有大量的单链匹配和完整的交联，包括许多强匹配。我们还详细分析了各种假阳性，并确定了几种具有单链的线性肽，以及一些难以置信的α-β肽段组合。
在控制假阳性的同时，最大限度地提高灵敏度的有用策略是：
· 确保覆盖所有搜库内容
· 仅使用必要的蛋白序列进行搜库，不必再添加其他序列
· 只关注排名第一位的匹配的碎片和可选择的结果
使用Mascot发表的特色文章
在这里，我们重点介绍了最近有趣且重要的文章，该文章采用Mascot进行蛋白质鉴定，定量或表征，如果您想要您的文章也在这里重点推荐，请发给我们 一个PDF或URL。
Isolation of acetylated and unmodified protein N-terminal peptides by strong cation exchange chromatographic separation of TrypN-digested peptides
Chih-Hsiang Chang, Hsin-Yi Chang, Juri Rappsilber and Yasushi Ishihama
Molecular & Cellular Proteomics November 2, 2020
作者开发了一种新的方法，通过富集N端肽来表征蛋白质的N端，且不需要衍生化或复杂的处理。该方法使用蛋白酶TyrpN，然后利用强阳离子交换(SCX)色谱法，根据正电荷的数量以及电荷的分布来分离肽段。使得蛋白质N端肽与内部肽分离。
他们通过比较大约4,000个肽对在SCX中的保留时间来评估这种分离，这些肽对的序列仅在末端Lys/Arg的位置上有所不同。TrypN酶解的肽段明显比Typsin类似物有更强的SCX保留能力。这是因为TrypN肽段的N端携带两个带正电荷的基团，而trypsin肽段C端Lys/Arg的正电荷被α-羧基部分中和。
他们将此方法应用于人胚胎肾细胞裂解液中，在单次LC/MS/MS运行中鉴定了1550个乙酰化肽和200个未修饰的蛋白N端肽，内部肽的污染率不到3%。
Mascot 小贴士
Sorry, the database (%s) is not currently available for searching
有点含义模糊。'%s'是一个字符串的占位符，信息应该为：
Sorry, the database (Uniprot_arabidopsis) is not currently available for searching
如果你在你的系统上看到了这个信息，而完整的信息可以让你更容易地找出问题的原因，你可以通过在Mascot Server上查看来获取全文。在Web浏览器中，从你本地的Mascot主页，单击链接到Database Status，然后是Error log。通过将日期和时间与客户端事件的日期和时间进行匹配，应该不难找到完整的信息。
以上就是本月Mascot简讯的全部内容，如果想要了解关于更多Mascot详情，欢迎点击“阅读原文”进入我们的官方网站或直接联系我们。
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