
GOLD (Genetic Optimisation for Ligand Docking) 是英国剑桥大学晶体数据中心 (CCDC, Cambridge Crystallographic Data Centre)开发的一款分子对接软件,其凭借CCDC海量的晶体数据在分子结合构象生成、含有金属离子参与的体系对接及有水分子参与的配体-蛋白质相互作用等方面有强大的功能和优势。

TOPIC 01
初识GOLD:GOLD的对接原理及其性能介绍
Basic introduction of GOLD:
the genetic algorithm and the performance of GOLD
11月24日(周四)15:00-16:00
此次讲座您将了解到GOLD的遗传算法、四种常用的打分函数等理论知识,同时我们将通过一个案例分析,为您介绍GOLD分子对接的流程、关键参数的设置及结果分析的方法。
TOPIC 02
大批量的分子对接:如何使用GOLD进行虚拟筛选
Ultra-large docking:
Using GOLD for High throughput virtual screening
12月08日(周四)15:00-16:00
虚拟筛选可以通过计算机模拟帮助研发工作人员快速地在海量化合物中筛选出具有目标靶蛋白活性的先导化合物,大大节省了实验时间和成本。目前GOLD支持在PC端、HPC集群或云端进行大批量虚拟筛选工作,此次讲座您将了解到如何使用GOLD进行虚拟筛选工作,以及如何进行虚拟筛选结果分析等。
TOPIC 03
如何使用GOLD进行
含有水分子或金属离子体系的分子对接
Docking with and without water using GOLD: Identify the solvated intermediate ligand-protein interaction
12月22日(周四)15:00-16:00
此次讲座您将了解到如何分析结合口袋中的水分子和金属离子的作用,并使用GOLD进行含有水分子或金属离子体系的分子对接。
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