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StarDrop 7.5新版本发布

StarDrop 7.5新版本发布 康昱盛
2023-10-07
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导读:StarDrop药物设计与决策平台已发布全新版本!

StarDrop药物设计与决策平台已发布全新版本。StarDrop 7.5为用户带来全新的Metabolism模块,用于更全面、更精准的代谢预测模拟。eSim3D模块现已支持基于配体的虚拟筛选。全新设计的二维结构对齐工具,让构效关系分析变得更加高效。





全新的代谢模块:Metabolism





StarDrop 7.5的全新代谢预测模块Metabolism取代了P450模块,为用户提供更深入的代谢预测模拟功能。Metabolism模块可用于设计代谢稳定性更高的分子,并帮助选择临床前代谢研究的实验动物种属。






1

更强大的代谢预测功能


Metabolism模块能够预测化合物的代谢途径、代谢位点及代谢产物,并覆盖了P450酶系在内的80%已报道的人类一相代谢酶(P450、AOX和FMO)和60%已报道的人类二相代谢酶。(UGT和SULT)。同时,Metabolism模块还会预测三种实验动物的P450酶代谢途径。

Metabolism模块有助于识别具有多条代谢途径的化合物,减少药物相互作用的风险,并提示最重要的代谢酶系,以确保实验测试能能够充分覆盖。

借助全新的WhichEnzyme™模型,StarDrop帮助用户识别负责人类药物代谢的五种关键酶家族。为了更精确地进行预测,StarDrop会使用WhichP450™模型来确定七种主要的人类CYPP450酶中,最有可能的代谢酶亚型。



2

代谢位点选择性模型:

提高化合物的代谢稳定性


Metabolism模块还包括了针对P450、FMO、AOX、UGT和FMO的位点选择性模型,帮助用户预测不稳定性的代谢位点,潜在的代谢可能性,并指导对化合物的修饰和设计,以提高其代谢稳定性。
Metabolism模块的启发式算法结合了来自WhichEnzyme、WhichP450和代谢位点选择性模型的预测结果,允许用户查看多个代谢产物并创建代谢途径,以识别最有可能的一相和二相代谢产物。

Metabolism模块能够为用户呈现更真实的体内药物代谢情况,并基于预测结果来识别潜在的有毒代谢物,或对分子进行优化以提高对相关酶的代谢稳定性。



3

预测临床前物种的P450代谢


StarDrop 7.5提供了大鼠、小鼠和狗的CYP450代谢预测模型,可与人类代谢预测进行比较。这将有助于确定临床前实验的动物物种,从而得到最匹配的代谢产物。





StarDrop 7.5的其他重要更新



4

Surflex eSim3D模块:

更强大的虚拟筛选


StarDrop 7.5版本增强了Surflex eSim3D™的虚拟筛选功能。借助由ForceGen算法预先计算出三维构象的商业化合物库,用户可以在台式电脑上进行基于配体的大规模快速虚拟筛选。

用户可以通过eSim3D模块实现基于配体的虚拟筛选,与一个或多个参考配体进行三维叠合(例如X射线共晶结构、低能构象或多配体结合假设),快速识别骨架跃迁分子或可购买的新颖活性分子。



5

全新的二维结构对齐工具


StarDrop核心模块新增了全新的二维结构对齐工具用户可以定义子结构,基于此来对数据集中的分子进行刚性对齐。通过持续地对齐数据集中不同骨架的化合物系列,您可以更方便地查看相同骨架的取代基变化情况,并理解对应的构效关系。您可以通过Data Set | Align 2D Diagrams使用此功能。


6

其他新增功能


在此版本中,用户可以通过在原位编辑结构来纠正数据集中的分子;此外,还可以通过按住CTRL键并滚动鼠标滚轮来缩放数据集。

如果您对StarDrop 7.5全新功能感兴趣,欢迎点击文末“阅读原文”联系我们!我们非常乐意为您进行软件演示,或者提供全新模块的软件试用

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