
OmicsBox真的是NGS分析软件升级最频繁的软件之一。
此次OmicsBox 3.3版本集成了一系列新功能和改进,提供改进的可用性、高级功能和扩展的数据库支持,以满足生物信息学社区的多样化需求。
Stefan Götz博士,BioBam Bioinformatics S.L.首席执行官今年已经发表多次升级感言,这次当然也不例外。
“我很高兴地宣布OmicsBox 3.3的发布,其中包含了我们社区一直热切期待的许多新功能。宏基因组学模块现在通过Silva、Greengene和GTDB提供额外的分类学分类。我们增强了转录组学模块,改进了批量、单细胞和长读长转录组学的数据分析功能,包括更好的时程分析、重新设计的长读长IsoSeq流程和TAMA合并选项。我相信,这些功能以及我们所做的所有其他改进,将进一步支持我们的用户加速他们的科学发现。”
以下是OmicsBox 3.3中包含的新功能和改进的详细列表:
宏基因组学
01
通过Silva、Greengene和GTDB进行新的分类学分类
单细胞转录组学
02
改进了大型数据集的UMAP性能
长读长转录组学
03
将转录组与TAMA Merge合并的新功能
重新设计的PacBio IsoSeq管道
转录组学
04
使用Masigpro改进时程数据分析
改进的差异表达分析基因过滤
新功能:批量重命名计数表和差分表达式结果的特征ID
新功能:重命名和删除计数表的样本
基因组分析
05
新功能:使用Busco进行基因组组装完整性评估
常规工具
06
所有选项卡中的新信息图标,用于查看分析详细信息
OmicsBox介绍
OmicsBox为企业、学术和政府研究生物学家提供基因组、转录组和宏基因组数据集的“开箱即用”数据分析和功能解释。我们的生物信息学软件OmicsBox被全球顶级的私营和公共研究机构使用。
OmicsBox由以下模块组成,可以根据需要进行配置:基因组分析、转录组学、功能分析和宏基因组学。功能分析模块包括Blast2GO功能注释方法,使Omicsbox在非模式生物研究中特别受欢迎,拥有超过10,000次科学引用。
OmicsBox依靠云计算来完成所有消耗资源的任务,如基因组组装或任何其他CPU或内存消耗算法。所有这些计算上具有挑战性的生物信息学管道都可以在Windows、Linux或Mac上的任何标准PC或笔记本电脑上使用OmicsBox透明地运行。OmicsBox基于订阅模式,具有非常灵活的许可选项。请与我们联系以获取更多信息。
如何更新?
OmicsBox将自动更新。如果您正在使用OmicsBox 2.0或更高版本,则无需执行任何操作即可更新到最新版本。
如果您仍在使用Blast2GO PRO,我们强烈建议您升级到OmicsBox。您可以通过以下链接下载最新版本(https://www.biobam.com/download-omicsbox/)。
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