【Mascot Newsletter2024-06】新版本Mascot测试版即将发布，新功能预览- 大数跨境

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【Mascot Newsletter2024-06】新版本Mascot测试版即将发布，新功能预览

康昱盛

2024-06-27

导读：欢迎阅读第115期Mascot资讯！

欢迎阅读第115期Mascot资讯！

⏩ASMS用户会议

⏩Mascot在ASMS

⏩关于Matrix Science

我们很高兴能在最近于加利福尼亚州阿纳海姆举行的ASMS大会上见到大家，并想与大家分享我们在Matrix Science用户会上介绍的一些新进展和信息。

会议上有许多出色的演讲，展示了Mascot在癌症蛋白质组学、生物标记物发现、定量蛋白质组学和生物制药等领域的应用。以下是我们汇总的一小部分内容。

Mascot：深受客户信赖25年的蛋白质质谱鉴定标准参考软件

Matrix Science在ASMS 2024

我们举办了一场早餐会议，会上介绍了多项Mascot的新开发功能。新版 Mascot Server的测试版即将发布。以下是一些令人期待的新功能。

机器学习：新版Mascot将整合MS2Rescore，这是一款由根特大学 Lennart Martens团队开发的模块化、用户友好的AI辅助肽段识别重评分平台。我们的目标是让您只需点击一个按钮，就能优化结果。为此，我们已将DeepLC和MS2PIP模型选项直接集成到Protein Family Summary报告的菜单控件中。

更快的容错搜索：目前，Mascot的容错搜索会尝试Unimod中的每个修饰，而Unimod中有超过2000种修饰。然而，大多数情况下，您对样本中明确不存在的修饰有一个大致的了解。在新版中，您可以从容错搜索中排除特定的修饰类别，例如氨基酸替代、同位素标记和人工修饰。这将使搜索速度更快且更精确。

自定义Distiller报告：Mascot Distiller 2.8提供了14种不同的报告，用于分析和导出您的定量结果，例如ANOVA方差分析、层次聚类、K-means聚类、PCA主成分分析、火山图、表格导出等。只需具备一些 Python和Mascot Parser库的知识，您就可以在Distiller中创建适用于新的应用场景和工作流程的自定义报告。

使用Mascot Daemon自动化操作：Mascot Daemon可以在任务完成之前或之后自动运行操作。这些操作可在External Processes对话框中设置，但由于机制非常灵活，设置也较为复杂。因此，我们编写了一个名为 Mascot Daemon Export Extender的封装程序，使得在任务结束时自动运行Distiller报告变得非常简单。

ASMS上使用Mascot的精选报告

以下是一些在ASMS大会上使用Mascot进行蛋白质鉴定、定量或表征的有趣报告。由于会议每天都有数百张海报，无法在此列出所有使用Mascot 的报告。

Chemical Proteomic Strategy Utilizing a Photoreactive Chloroalkane Capture Tag for Target Discovery (TP680)

Alba Katiria González Rivera, Robin Hurst, Sergiy Levin, Michael M. Rosenblatt, Rachel Friedman Ohana

采用具备足够的光交联和高度选择性富集能力的多功能氯化烷烃捕获标签，简化靶点解析策略。

Identification of 15-keto-PGE 2 post-translational protein modifications by LC/MS/MS to study an anti-inflammatory therapy (TP720)

Fu-An Li, Ling-Hui Wang

我们的结果表明，通过服用15-酮-PGE2，可以作为一种新的抗炎疗法来治疗饮食诱导的NASH。

Peptide Biomarkers in Human Breast Milk: Mass Spectrometry-Based In-Solution Proteomics Analysis for Early Detection and Treatment of Breast Cancer Development (WP066)

Victor Tochukwu Njoku, Danielle Whitham, Lilian Corrice, Brian T. Pentecost, Kathleen F. Arcaro, Costel C. Darie

验证了人类母乳中用于早期检测和治疗乳腺癌的特定潜在肽标志物。

Acetylome analysis of aspirin treated AML cell lines using label-free LC-MS/MS reveals potentially cytostatic modifications in cytosolic and mitochondrial proteins (ThP139)

Luke Higgins, Tommy Shields, Vinothini Rajeeve, Pedro Rodriguez Cutillas

首次分析阿司匹林诱导的AML乙酰化组，揭示了阿司匹林对蛋白质乙酰化的新作用。

Proteomic evaluation of tardigrades following ionizing radiation reveals increase in DNA repair pathways (ThP791)

Evan R Stair, Courtney Clark-Hatchel, Bob Goldstein, Leslie M. Hicks

揭示了水熊虫对电离辐射的耐受机制。

Matrix Science

Matrix Science为蛋白组学的研究人员以及科学家提供生物信息分析工具，帮助大家更快速，更可信的鉴定和定量蛋白。Mascot软件全线支持来自AB Sciex，Agilent，Bruker，Shimadzu，Thermo Scientific以及Waters质谱仪生成的质谱数据。请联系康昱盛以获取更多的信息。

Matrix Science

以上就是本月Mascot咨讯的全部内容，如果想要了解更多Mascot软件详情，欢迎进入我们的官方网站或直接联系我们。

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