
欢迎阅读第127期Mascot资讯!
⏩ ASMS用户会
⏩ Mascot在ASMS
⏩ Matrix Science海报
⏩ 关于Matrix Science
我们很高兴在近期于马里兰州巴尔的摩市举行的ASMS会议上见到大家。以下是我们年度用户会议的概要,包括Mascot DIA预览。
我们收录了部分利用Mascot进行蛋白质鉴定、定量或表征的ASMS海报并在会上展示。
Matrix Science在ASMS上展示了两张关于将机器学习应用于非标记定量研究的海报。
Mascot:25年来值得信赖的质谱蛋白质鉴定参考标准
年度用户会总结
Using MS2Rescore to boost identification rates in complex samples.
根特大学/VIB-UGent医学生物技术中心的Tim Van Den Bossche描述了MS2Rescore的工作原理,并展示了使用机器学习进行重评分的优势。
Mascot DIA: Universal spectrum-centric approach.
Matrix Science的Ville Koskinen展示了Mascot Server和Mascot Distiller下个版本中计划支持的DIA功能。
Mascot DIA: Thermo LFQ example.
Matrix Science的Patrick Emery使用即将发布的Mascot Server 3.2(测试版)和Mascot Distiller 3.0(测试版),分享了针对一个Thermo Orbitrap DIA项目的初步分析结果。
精选的使用Mascot的ASMS报告
以下是ASMS会议上一些利用Mascot进行蛋白质鉴定、定量或表征的有趣报告。由于会议每天都有数百个海报,因此我们无法在此列出所有Mascot海报。
⏩ MP 282 Species identification of the DNA-degraded blood drop in the complex matrices by nanoLC-MS/MS
Katarzyna Staniszewska, Malgorzata Hopcias, Paulina Kret, Piotr Suder
陈旧的微小血迹在挑战性材料载体上仍可实现物种溯源,即使DNA已完全降解或受污染。
⏩ TP 135 Quantitative Proteomics of Silva Patterns and the Tumor Microenvironment in Cervical Adenocarcinomas
Jonathan Ogata, Sarah M. Drayer, Sean Cronin, Jordyn Tumas, Saeid Movahedi-Lankarani, Tamara Abulez, Kelly A. Conrads, Brian L. Hood, Jordan Driscoll, Kathleen M. Darcy, Christopher M. Tarney, G. Larry Maxwell, Thomas P. Conrads, Nicholas W. Bateman, Neil T. Phippen
定量蛋白质组分析揭示了侵袭性Silva C亚型宫颈腺癌特有的肿瘤及基质蛋白异常。
⏩ WP 675 Identification and quantification of 4-HNE-adducted proteins to study the metabolic disorders of the ALDH2 gene mutation
Fu-An Li, Ling Hui Wang
ALDH2突变通过4-羟基壬烯醛(4-HNE)加合破坏褐色脂肪组织(BAT)功能,导致能量消耗降低和饮食诱导性肥胖,ALDH2激活剂可逆转此效应。
本研究旨在探讨发芽与未发芽条件下,有色(红、紫、黑)及无色水稻的代谢组学特征。此外,研究通过FRAP、DPPH及总抗氧化剂检测试剂盒评估抗氧化性能,并分析发芽水稻中蛋白质表达模式及蛋白质鉴定结果。
⏩ ThP 097 Monitoring the estrogen-inducible proteins in Lake trout (Salvelinus namaycush) from Great Lakes upon exposure to environmental contaminants
Taniya Modhishika Jayaweera, Krishan S Weraduwage, Bernard Crimmins, Sujan Fernando, Thomas M Holsen, Costel C. Darie
本项目的核心目标之一是监测湖鳟鱼(Salvelinus namaycush)和大眼狮鲈(Sander vitreus)在接触环境污染物(大湖区内)时,特定肝脏蛋白的表达情况。目前尚无监测鱼类体内内分泌干扰物(EDCs)影响的方法;本研究将首次建立此类监测体系。
Matrix Science 海报展示
Matrix Science在ASMS海报展示会上展示了两份海报。PDF版文件可免费从我们的网站下载。
TP 505: Customizable machine learning adapter improves LFQ in Mascot Distiller.
Mascot Distiller中的非标记定量分析现可利用机器学习进一步优化结果。通过使用基准 DDA LFQ 数据集演示了该workfolw。
ThP 265: Machine learning-enabled Mascot Server API improves LFQ in client software like Thermo Proteome Discoverer.
Mascot Server 可将优化后的结果导出至其他软件平台(如 Thermo Proteome Discoverer)。在机器学习支持下,非标记定量分析的准确度与精准度保持稳定的同时,定量到的蛋白质数量显著提升。
Matrix Science
Matrix Science为蛋白组学的研究人员以及科学家提供生物信息分析工具,帮助大家更快速,更可信的鉴定和定量蛋白。Mascot软件全线支持来自AB Sciex,Agilent,Bruker,Shimadzu,Thermo Scientific以及Waters质谱仪生成的质谱数据。请联系康昱盛以获取更多的信息。
Matrix Science
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