
来源:exosomes
又到周三啦,小伙伴们是不是跟小编一样很期待我们今天会分享怎样一篇令人轻松愉快的小文献呢。那让我们一起看看外泌体这小东西还有什么不为人知的作用吧~

喏,这就是我们今天要分享的文章啦:外泌体通过调节基因表达和剪接复合体的装配来控制可变剪接
Table 1.dsrrp44损伤中的差异性表达基因的KEGG通路分析(QA+ vs.QA−)

Figure 1.在dsrrp44损伤中,某一剪接体组分与剪接体相关基因的表达被上调。

(A)snRNA表达的qRT-PCR分析
(B)dsrrp44损伤中的基因

(C)存在或不存在QA时,dsrrp44损伤中的18种mRNA编码的剪接体组件的RT-PCR。加入硫藤黄素来抑制转录。在加入后的0、15、30、45分钟获得样本。左图:三个独立实验的典型结果;右图:mRNA降解的密度分析,设定0分钟时的密度为1。
Table 2.dsrrp44损伤中snRNP和剪接体相关基因上调

Figure 2.敲低dsprp5, dsU4-2 和 dsprmt5后的典型剪接基因。

(A)用Northern blot方法确认dsprp5, dsU4-2和dsprmt5 被敲低。
(B-D)RT-PCR结果展示NCU07995, NCU08166, NCU04486 和 frq I-6的剪接在dsprp5敲低 (B), dsU4-2敲低(C)和 dsprmt5敲低 (D)
(E)在野生型和dsprp5损伤6小时增量后,在DD12至DD42上的frq I-6可变剪接的RT-PCR分析。
Figure 3. RRP44调节剪接复合体和可变剪接的装配。

(A)在QA存在和不存在情况下,用western blot方法在dsrrp44损伤生长的蔗糖浓度梯度片段中发现PRP5蛋白。上图:使用蔗糖梯度分离和western blot分析的方法发现典型PRP5。下图:PRP5分布的密度定量。
(B、C)在QA存在和不存在情况下,U5 (B) 和U6-2 (C) snRNAs在dsrrp44损伤生长的分布。上图:三个独立实验的典型结果。下图:三个独立实验的定量。每个实验的12种密度分析的总值标准化为1。
(D)RNA测序分析QA存在和不存在时dsrrp44损伤生长差异调节可变剪接。

(E-H)RT-PCR结果展示在QA存在和不存在时dsrrp44损伤生长的四种基因的差异性剪接。野生型作为对照。上图:有或没有QA时dsrrp44的四中可变剪接的Sashimi plots。高度代表总的阅读范围。下图:三个独立RT-PCR的典型结果。
Figure 4.外泌体和剪接体对可变剪接的调控。

(A) RT-PCR结果展示在QA存在或不存在时,添加硫藤黄素后,dsrrp44损伤测试基因剪接变异的改变。样本取自硫藤黄素添加后0,15,30,45,60和120分钟后。
(B) 上图:RT-PCR结果展示在QA存在或不存在时,在dsprp5, WT 和 dsrrp44中NCU05290的剪接。下图:NCU05290 在dsprp5和WT中的密度定量分析剪接/未剪接之比。
(C)上图:RT-PCR结果展示在QA存在或不存在时,dsU4-2, WT 和 dsrrp44中NCU07421的剪接。下图:NCU07421 在dsU4-2和WT中的密度定量分析剪接/未剪接之比。
Figure 5. RRP44区别控制frq 变异体的降解和剪接。

(A) RT-PCR展示在QA存在或不存在时,三种温度dsrrp44损伤的剪接片段。除了I and II, 其余难以发现, III-VIII是做了标记的。
(B)25℃时定量比较剪接变异体与总转录量。
(C) RT-PCR结果展示了frq 变异体(左)的降解与III, IV, VI和VII变异体在0和15分钟(右)的密度定量。0分钟时的RNA水平设为1。

(D) 图示frq I-6剪接和相应蛋白产物l-FRQ和s-FRQ。水平箭头表示PCR引物frq I-6的相对位置。垂直箭头表示三个起始密码子的位置。
(E,F) 存在或不存在QA时,RT-PCR结果和frq I-6密度定量在dsrrp44 (E) 和 WT (F)损伤生长的剪接。
(G,H) 存在或不存在QA时,比较 s-FRQ/l-FRQ 之比在dsrrp44 (G)和WT (H) 损伤生长。
Figure 6. 外泌体通过多重途径调节剪接。

外泌体通过剪接体依赖和非依赖途径来调控未剪接/剪接转录本水平。剪接体依赖途径,外泌体通过影响基因表达、剪接体装配和snRNAs的加工和转换来调节剪接。剪接体非依赖途径,外泌体介导前体mRNAs在核内的降解,这是胞质中剪接和非剪接转录本的转换。
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