2024年7月22日,南京医科大学丁强团队在Cancer Research(IF=12.5)在线发表题为“FANCI Inhibition Induces PARP1 Redistribution to Enhance the Efficacy of PARP Inhibitors in Breast Cancer”的研究论文。该文章发现抑制FANCI可以作为一种增强PARP抑制剂乳腺癌治疗的新策略。
尽管PARP抑制剂为BRCA基因突变的乳腺癌患者带来获益,但长期使用仍出现了耐药的情况。此外,对于非BRCA突变的乳腺癌患者使用PARP抑制剂治疗时出现的耐药情况,目前也无法解决。针对已知的耐药机制,包括HRR活性恢复,PARP捕获受损等,尚缺乏有效策略以克服。临床前数据显示,采用药物联合的方案或对产生单药PARP抑制剂耐药性的肿瘤有效。因此,本文就在乳腺癌中寻找一种新的联合治疗策略以增强PARP抑制剂疗效展开研究。
1、FANCI在乳腺癌患者中高表达且与患者不良预后显著相关
作者首先利用ONCOMINE开发数据库发现,FANCI在17种癌症类型中表达上调,尤其是在乳腺癌中。此外,通过分析TCGA数据发现与正常组织相比,乳腺癌组织中的FANCI 表达更高。在乳腺癌组织/细胞系与正常组织/乳腺上皮细胞系的qRT-PCR和Western blot 实验中,进一步证实乳腺癌组织和细胞系中FANCI表达升高。随后的Kaplan-Meier分析,发现FANCI高表达的乳腺癌患者表现出无复发生存率 (RFS)、进展后生存率 (PPS)、无远处转移生存率 (DMFS) 和总生存率 (OS) 较差的趋势。
作者在四种非BRCA突变细胞系中分别构建了FANCI过表达和敲低细胞株,通过CCK-8、克隆形成以及Edu细胞增殖实验证明了FANCI可以促进乳腺癌细胞的增殖能力。接着又采用异种移植瘤模型在体内证明了FANCI促进乳腺癌细胞的生长。
由于迁移和侵袭是乳腺癌的一个重要特征,作者研究了FANCI对乳腺癌细胞迁移和侵袭的影响。通过细胞划痕和Transwell实验发现FANCI敲低后乳腺癌细胞的迁移和侵袭能力显著降低,相反,FANCI的过表达增强了乳腺癌细胞的迁移和侵袭。
作者鉴于FANCI在DNA修复中的作用及其对蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)的倾向,通过蛋白质谱(基于Q-score排名)发现PARP1与FANCI互作的潜力最高。随后,利用STRING数据库及TCGA中的乳腺癌样本分析,发现FANCI和PARP1的表达表现出正相关性。接着通过构建FANCI不同截短体进行免疫沉淀实验,发现FANCI通过其F5片段(555-803aa)与PARP1互作。但实验发现FANCI并不会影响PARP1的表达,考虑PARP1主要在细胞核内发挥功能,于是作者研究了FANCI对PARP1核质分布的影响。WB、IF以及ELISA实验显示,FANCI敲低后PARP1的核定位急剧降低,表明FANCI可以通过调节PARP1核质分布来改变PARP1功能。
在明确了FANCI可以调节PARP1功能后,作者为了进一步验证PARP抑制剂与FANCI/PARP1的关系,利用抗癌药物敏感性基因组学数据库(GDSC),筛选出了受 FANCI 影响的 PARP 抑制剂talazoparib。CCK-8实验显示,与接受talazoparib治疗的对照组相比,FANCI敲低后细胞活力显著下降,说明FANCI敲低后乳腺癌细胞对talazoparib更敏感。随后,通过蛋白质印迹法和免疫荧光染色检测γH2AX表达量,发现FANCI敲低后,与对照组相比,talazoparib治疗后能观察到更多的γH2AX灶,表明治疗后乳腺癌细胞DNA损伤增强。为了在体内进行验证,作者构建了异种移植瘤小鼠模型并给予talazoparib治疗。实验结果显示,FANCI敲低可以抑制乳腺癌细胞的生长,而加入PARP抑制剂(talazoparib)会显著增强这种治疗效果。
为了一定程度缓解乳腺癌患者PARP抑制剂耐受以及拓宽乳腺癌治疗策略,作者利用CTD数据库找到了能够抑制FANCI表达的药物palbociclib,该药物也是CDK4/6的抑制剂。为了验证talazoparib和palbociclib联合用药策略的有效性,随即进行了CCK-8实验,结果显示talazoparib和palbociclib表现出协同效应,二者联用高效抑制了非BRCA突变的乳腺癌细胞活性。由于HRR活性恢复是乳腺癌PARP抑制剂耐药的机制之一,作者为了进一步探索palbociclib介导的FANCI表达抑制在克服这一耐药机制方面的潜力,通过在BRCA1突变的乳腺癌细胞中敲低53BP1,模拟HRR恢复的状态。Western blot实验结果表明处于HRR恢复(53BP1-si)状态的细胞对PARP抑制剂的敏感性降低(RAD51表达增加),而当用palbociclib处理后细胞RAD51 表达显著降低(RAD51为PARP抑制剂敏感性的检测指标)。随后作者计算了talazoparib和palbociclib联用的CI指数,发现在talazoparib (500 nM)和 palbociclib(5 µM)这个比例的浓度下协同治疗效果最佳。最后在动物实验中也获得了一致的结果。

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