表观遗传学
基因序列与健康有关,但是在不改变基因序列的情况下,亦可以对生物体的基因表达造成影响。
”表观遗传学(epigenetics)“就是研究行为、环境和表型如何改变基因活性和表达的科学。与基因变异不同,表观遗传修饰变化通常是可逆的,而且不会改变 DNA 序列[1]。
常见的变化包括 DNA 甲基化,和组蛋白的甲基化、乙酰化、磷酸化等修饰,这些修饰可以影响结构染色质,进而影响基因转录活性。
DNA 甲基化检测
DNA 甲基化经常通过亚硫酸氢盐法(Bisulfite)进行检测,将亚硫酸氢盐 PCR 与 Luminex 微球技术相结合,便可形成了一种高通量、高分辨率 DNA 甲基化分析方法,用于快速分析 DNA 甲基化[2-4]。
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Bisulfite conversion 用亚硫酸氢钠处理,将未甲基化的胞嘧啶转化为尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不受影响。
MIP
PCR 扩增时其中一个引物在 5' 端生物素化。 Hybridization reaction
SAPE incubation
检测流程示意图[4]
组蛋白修饰检测
除了 DNA 甲基化之外,另一个表观遗传调控较为成熟的标志就是组蛋白的翻译后修饰 (post-translational modification, PTM)。组蛋白尾部特定氨基酸残基的磷酸化、乙酰化和甲基化可致使染色质结构的空间发生变化,从而调节包括转录、复制和 DNA 修复等过程。
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Capture 样本与磁珠上偶联侦测组蛋白的各项 PTM 的抗体孵育结合。
Detection
加入侦测 PTM 的生物素化抗体,以及荧光蛋白 SAPE,藉由链霉亲和素与生物素结合标记微球上的复合物,再依据荧光信号确定组蛋白的修饰变化。

双抗夹心法示意图[5]
总结
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表观遗传学在不改变基因的情况下调节基因表现。 在微球上搭建检测法,可灵敏且高通量对 DNA 甲基化及组蛋白修饰进行多靶点侦测。
参考文献
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