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xMAP 实验策略及优化:一道绿光照向你-报导基团

xMAP 实验策略及优化:一道绿光照向你-报导基团 路明克斯
2022-06-22
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导读:你可能想问系列之-荧光报导基团


在 xMAP 仪器上,每检测完一孔,软件就能马上给出荧光数值,那么换种荧光试试行吗?显示的数值又是如何计算出来的呢?如果这些疑问也在你脑中飘过,这篇文章你肯定不能错过,快来文中找答案吧!




xMAP 的检测原理介绍时,我们曾经说过仪器会对微球上的两种荧光信号进行检测,一种是微球本身红染料的荧光,另一种则是以绿光激发实验中报导基团的荧光信号,这个报导荧光信号来自微球表面偶连核酸或是蛋白检测复合物的荧光。




报导基团荧光选择

实验中经常使用的报导基团可以是荧光白或是有机染料, 在 xMAP 的实验中亦然。

荧光蛋白》

SAPE (Streptavidin Phycoerythrin)

这是一种由藻红荧光蛋白与链霉亲和素共价组成的荧光标记物, 因为具有亮度高水溶性好的特性,是最常使用的报导基团,不只在 Cookbook推荐使用,在 Luminex 自己以及合作伙伴的商品化试剂中也都使用 SAPE 作为报告荧光。链霉亲和素对生物素具有强亲和力,使用生物素标记的核酸片段以及目标蛋白,可与 SAPE 结合形成复合物,在通过仪器的光学检测部件时被识别出来。

有机染料》

除了 SAPE 之外,有机染料如 Alexa 532 以及 Cyanine 3 也可作为 xMAP 实验时的报告基团。一旦标记荧光染料的核酸探针或是蛋白与微球形成复合物,便可在通过仪器的光学部件时被检测到信号,有机染料虽然亮度不及 SAPE,但省去加入报告分子的步骤,且具有极佳的热稳定性,使其于实际应用上仍具优势。

相对报告荧光强度 [1]




报导基团荧光值计算法

在微球实验中,每一个通过光学部件被识别的微球,无论强度及实验结果的阴阳性,其上的报导基团荧光值均会被仪器辨认,并以 “荧光强度(Fluorescent Intensity;FI)的单位记录下来。
一种微球编码可对应一种检测靶标,而实际检测时并非由一颗微球来完成一个靶标,而是使用多颗微球对一个靶标进行检测,所以会得到多个 FI 的数值,xPONENT 软件会将这些 FI 再透过统计分析,最后给出该靶标的实验结果
关键字是 “Median”!
仔细查看过数据的小伙伴,一定发现 xPONENT 或是 CSV 数据档中,“Median” 在这边出现!
其实,MFI 字头的 "M"“Median”,而 MFI 出现在 xPONENTCSV 数据档、PDF 报告、甚至 TDAS 软件中!

MFI 中值荧光强度》
MFI 是 Median Fluorescent Intensity 的缩写,中文为中值荧光强度;xMAP 微球实验中,我们建议大家使用中值进行分析,计算的方式便是将所有相同编号上检测所得的 FI 荧光值,按照强度依序排列后取其中位数值。
大家是否很好奇,为什么我们使用中值而不是均值呢?
使用中值可以避免异常值(极高或是极低)所组成的影响;另一方面,样本在 xMAP 分析仪上运行时,会有少量的孔间微球携带转移,使用中值计算时,可消除微球转移污染造成判读误差的可能。

举例说明:
假设读板顺序相连的两个样本中,A1 样本为强阳性(荧光值可超过 20000),其后一孔 B1 样本正巧为阴性(荧光值不超过 100),若使用均值计算结果时,即使少量的携带污染微球从 A1 转移到 B1 ,都能使得计算后的结果大幅偏离实际的状态!




想了解更多数值?

你是否也好奇,在上样读板的过程中,仪器都记录了哪些数据,软件中能不能看到这些数据呢? 

其实,当仪器采集样本时,对于能被仪器正确识别的微球,仪器会进行颗粒数量计算(Count);而当记录微球上报导基团的 FI 值后,xPONENT 软件还可依据 FI 进行包括中值、均值、标准差、峰值、修剪值、甚至偏差值进行运算。

上述的这些数据,在 ”Statistic“ 处旁下拉选单,都可以依据需求显示。





总结


读完之后对于那道绿光照射之后获得的数据是不是又多了解一点?
绿光假使还不够,具备双报告激光通道的 INTELLIFLEX 还有 405 nm 紫光,提供实验室在决定报导基团种类时有更多样的选择


考文献

[1] Luminex internal study.


下载 Cookbook 
了解更多关于 xMAP® 的实验策略及优化!


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Luminex公司总部位于美国奥斯汀,是全球知名的医疗科技公司之一。本号将介绍公司世界领先的液相芯片平台相关产品、先进的全自动分子生物学体外诊断产品,并提供相关技术知识、报道最新进展,构架与客户之间的桥梁。
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