根据人社部的最新统计，我国三项基本医保制度（职工基本医疗保险、城镇居民医保、新农合）目前覆盖人数已超过13亿人，全民医保体系已基本形成。
但是，这三项制度从覆盖群体、管理部门、制度设置等方面均有不同。如，城镇职工主要覆盖的是在职人员，城镇居民医保主要涉及城镇户籍的居民，新农合主要覆盖农村户籍居民；同时，城镇职工和城镇居民医保主要由人社部门管理，新农合多数地方由卫生部门管理；职工医保由用人单位和职工共同缴纳基本医疗保险费，城镇居民医保和新农合则是财政支出占大头，个人缴纳一小部分；职工医保是连续缴费，缴够一定年限后即可终身享受医保待遇，而新农合和城镇居民医保则需按年缴纳保费，交一年保障一年，中断缴费则不再享受相关待遇。
管理部门不同、筹资机制有别、报销制度和保障水平均存在明显的差异，相关争议由来已久。从另外一个角度来看，也恰恰是由于这么多的差异，医保并轨的难度才会更大，其中一个根上的问题就是医保管理权的问题。
在新一轮国务院机构改革和职能转变方案中，明确提出要“三保合一”，由一个部门承担管理职责，但医保管理权争夺之战也从未停歇，以至于“三保合一”至今未有终局。
1月初，国务院发布《国务院关于整合城乡居民基本医疗保险制度的意见》明确指出，整合城镇居民基本医疗保险和新型农村合作医疗两项制度，建立统一的城乡居民基本医疗保险制度。也就是说，基本医保整合将分两步走，在缴费和待遇衔接上先实现城镇居民医保和新农合两保合一。
1月19日，人社部副部长游钧表示，整合城乡医保，各省要统筹体制整合、制度整合、经办整合3个层面，于6月底前对推进工作做出总体规划，统筹地区要于12月底前出台具体实施方案，并同步做好预算安排、参保登记、费用征缴等实施准备工作，力争2017年统一制度正式启动运行。
医保“二保合一”后，城乡居民都将得到更多实惠，尤其是农民。由于保障待遇的侧重点不同，城镇居民医保主要保住院和门诊大病兼顾普通门诊，所以住院及门诊大病待遇都要高于新农合，而新农合的门诊待遇水平要高于城镇居民医保；但是，新农合可报销的医药目录比城镇医保少，同时，在市级医院平均报销比例比城镇居民医保低20%左右，最高封顶也比城镇居民医保少。
根据人社部提供的数据显示，目前，全国已有天津、上海、浙江、山东、广东等8个省(区、市)和新疆生产建设兵团以及部分市、县实现了城乡居民基本医保制度的整合。从这些已经推行了“两保合一”的地区来看，基本推行的是“目录就宽不就窄、待遇就高不就低”的原则，同时，农村居民此前在新农合的政策下是县级统筹，就医主要在县医院及以下的基层医疗机构，制度整合后提升为市级统筹，农村居民的就医范围将扩大到市级医疗机构，从而能够与城镇居民同等享受高水平的医疗服务。
这样一来，新农合的保障水平将向城镇居民看齐，农民的看病负担将进一步减轻。但是中国农民有8亿之多，这个庞大的数量带来的筹资差额僵尸接下来必须要应对的问题。就目前来看，两项医保的统筹层次还相对较低，大都以地级统筹为主，因此不会立马出现费用大幅上涨的情况，两者之间的差额也不会那么多，但随着统筹层次的提高，这个问题确实会比较突出。而解决问题的关键就是做大医保的基金池，基金规模越大抗风险能力越强，同时，减少因重复参保而增加的无效财政补贴，将这部分补贴用来弥补两项医保合并后的差额。
据了解，由于三项基本医保制度不统一，造成重复参保情况十分普遍，无疑增加了个人和国家负担。曾有专家粗略计算，新农合、城镇居民医保、城镇职工医保三大制度的全国重复参保率目前达10％左右，也就是说，重复参保人数已超过1亿人。结果就是，一方面增加了居民缴费负担，另一方面每年财政无效补贴超过200亿元。
要解决重复参保问题，就必须在源头上遏制。既然知道制度上缺乏明确的衔接办法，各地受利益驱动，在转移接续上积极性不高，就应该下大力气整顿。