东盟退证频发的主要原因是东盟特别是印度尼西亚、越南和泰国等国海关加大了对原产地证书的核查，核查重点货物的原产地规则、品名描述和第三方发票等。遇到有疑问或填制不规范的证书，即采取暂缓给予关税优惠、先行扣压货物和收取保证金等措施，有的国家海关甚至不理会查询结果，直接不给予优惠，给企业造成了严重损失。因此，出口企业须加强对自贸区原产地规则及政策的了解，严格按照自贸区规则和签证要求申领证书。
对于东盟证书特别要关注以下几个问题：
一是每份原产地证书涵盖的产品名称不得超过20项。否则，须将发票分开，申请两份以上证书。且每项品名都须分栏填写各自对应的H.S编码、数重量和原产地标准等信息。
二是东盟各国海关，尤其是印度尼西亚海关对“WO”（完全原产）要求很严格，认为只有土生土长的产品才可以填“WO”。因此，企业应特别关注产品原材料产地情况，若使用进口成分应如实申报。
三是如使用第三方发票通关，则须在证书注明第三方信息，即第十栏须填写第三方发票号和日期，第七栏加注中国内地以外的第三方的公司名称。
四是东盟证书背页说明第五条规定，应在货物描述中列明生产商名称。因此，企业应在证书第七栏备注处列明生产商名称（若申请人是外贸公司，也应显示生产商），以免引起退证。
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