对设在合作区符合条件的产业企业减按15%的税率征收企业所得税。横琴2021版企业所得税优惠目录包括了九大类150项。
对在合作区设立的旅游业、现代服务业、高新技术产业企业新增境外直接投资取得的所得，免征企业所得税。
对在合作区设立的企业，新购置（含自建、自行开发）固定资产和无形资产（除房屋、建筑物外）：
对在合作区工作的境内外高端人才和紧缺人才，其个人所得税负超过15%的部分予以免征。
对在合作区工作的澳门居民，其个人所得税负超过澳门税负的部分予以免征。
享受上述优惠的所得包括来源于横琴粤澳深度合作区的综合所得（包括工资薪金、劳务报酬、稿酬、特许权使用费四项所得）、经营所得以及经地方政府认定的人才补贴性所得。
