PubMed停止更新文献数据
Pubmed无法获取11月7日之后上线的最新文献
截至2024年11月7日，PubMed的最新文献更新已暂停，至今仍未恢复。这一情况已经持续了六天。许多科研人员猜测，这可能与美国政府近期的行政命令有关，该命令限制了某些国家（包括中国）对敏感数据的访问。但是有报道称，PubMed的停更可能与美国政府的资金短缺有关，由于拨款未到位，相关机构可能无法正常运营。由于Pubmed的停止更新，导致许多依赖PubMed进行文献检索的科研人员科研压力陡增。PubMed作为全球最大的生物医学文献数据库，其停更或许会影响科学研究的进展，尤其是在临床医学和公共卫生等领域。
如果Pubmed永久停止更新应该怎么办
个人认为，Pubmed作为一个集合了不同期刊论文的数据中心，确实为众多科研工作者在了解领域前沿进展中起到了巨大作用。但是当今科学研究逐步细化的时代下，每个科研工作者应该熟悉并了解自己研究领域内的学术期刊。科研工作者应该具有主观能动性，即自主去访问这些学术期刊的官网，快速了解这些学术期刊近期已发表的论文和即将发表的论文。比如Science, Nature, Cell等综合性高水平权威期刊，或者领域内的专业学术期刊，也可以是如bioRxiv或medRxiv等预印版网站，在境外还可以通过谷歌学术了解最新文献。不能因为Pubmed的停止更新为自己找借口而减少甚至懈怠前沿文献阅读。下面我列举一些Cancer或Virus领域的专业学术期刊。这些期刊中有高水平学术期刊，也有一些所谓的"水刊"。不管这些期刊口碑如何，相信一定能通过泛读期刊文献，找到可以驱动个人学术想法的文献。要以积极的态度去面对科研。
Cancer领域相关的期刊
1.CA: A Cancer Journal for Clinicians
2.Nature Reviews Clinical Oncology
3.Nature Reviews Cancer
4.Annals of Oncology
5.Cancer Cell
6.Journal of Clinical Oncology
7.Lancet Oncology
8.Cancer Discovery
9.Journal of Hematology & Oncology
10.Molecular Cancer
11.Nature Cancer
12.JAMA Oncology
13.Journal of Thoracic Oncology
14.Cancer Communications
15.Neuro-Oncology
16.Journal of the National Comprehensive Cancer Network
17.Trends in Cancer
18.JACC: CardioOncology
19.Blood Cancer Journal
20.Leukemia
病毒学领域相关的期刊
1.Nature Reviews Microbiology
2.Nature Reviews Immunology
3.Cell Host & Microbe
4.Annual Review of Virology
5.Nature Communications
6.PLoS Pathogens
7.Journal of Virology
8.Emerging Infectious Diseases
9.Virus Research
10.Virology
11.Clinical Microbiology Reviews
12.Journal of General Virology
13.mBio
14.Viruses
15.Journal of Infectious Diseases
16.Frontiers in Microbiology
17.Microbiology and Molecular Biology Reviews
18.Current Opinion in Virology
19.Transboundary and Emerging Diseases
20.Infection and Immunity
通过网络爬虫快速获取目标期刊论文的关键信息
除了自主登录学术期刊官网快速泛读文献信息，还可以通过爬虫的方法爬取不同学术期刊官网的最新文献信息，提取自己关注的关键词，从而提高文献检索的效率。下面是一个简单的python程序通过requests方式爬取学术论文信息。这个程序是一个伪代码，实际爬取文献信息时需要根据期刊网站的具体信息修改代码，同时也要注意避免可能涉及违反网站的使用条款或法律规定。许多网站禁止未经授权的自动抓取。建议查看网站的机器人协议（robots.txt）或使用其提供的API获取数据。
import requests
from bs4 import BeautifulSoup
def fetch_nature_articles():
# Nature期刊的最新文章页面URL
#url网站中可以随时替换网址为自定义期刊论文的网址
url = 'https://www.nature.com/nature/articles'
# 发送HTTP请求
response = requests.get(url)
# 检查请求是否成功
if response.status_code == 200:
# 解析HTML内容
soup = BeautifulSoup(response.text, 'html.parser')
# 找到所有文章的标题和摘要
articles = soup.find_all('article')
for article in articles:
# 提取标题
title = article.find('h3').get_text(strip=True)
# 提取摘要
summary = article.find('p').get_text(strip=True) if article.find('p') else '无摘要'
# 打印标题和摘要
print(f'标题: {title}')
print(f'摘要: {summary}')
print('-' * 80)
else:
print(f'请求失败，状态码: {response.status_code}')
if __name__ == '__main__':
fetch_nature_articles()