获批使用Alphafold3模型参数
写在前面的
之前的推送介绍了如何从github下载Alphafold3的推理代码和安装部署Alphafold3的依赖数据库。但是完成这两个步骤还不能使用Alphafold3，因为训练好的模型参数还没有获得。在这里我做一个比较肤浅的解释：推理代码像组成人的骨骼，肌肉等，依赖数据库像组成人的皮肤。由于Alphafold3是蛋白质及其他生物大分子结构和相互作用预测的模型，模型参数就像人的大脑。仅有推理代码和数据库就像是一个没有大脑的人，此时的Alphafold3是残缺的，还不能完成良好的结构预测。因此请求DeepMind公司获得模型参数，给这个没有大脑的“人”安装能够思考的大脑，是非常关键的一步。
申请步骤总结
1.访问申请页面：前往Google DeepMind提供的申请表单链接，填写相关信息。
2.填写申请表单：
*提供组织邮箱地址（如name@university.ac.uk）。
*填写Google账户邮箱地址（如Gmail），这将用于下载模型参数。
*输入全名和居住国家/地区。
*填写所属非商业组织的全称及其所在国家/地区。
*如果申请组织有公开网站，请提供其URL。
*共享条款：在申请中，需要确认是否计划在您的非商业组织内部共享AlphaFold 3模型参数的访问权限。
3.提交申请：确保所有信息准确无误后，提交申请。
*使用条款:AlphaFold3的模型参数仅供非商业用途，使用时需遵守相关的使用条款。不得将模型参数用于商业活动或与商业组织相关的研究。
申请材料被获批
前两天收到了来自DeepMind团队的邮件，被告知获批使用Alphafold3。
邮件的大概意思是说我获批了使用Alphafold3的模型参数权限，Google给了我个人的可下载链接，其中包含模型参数。我需要在7天内下载这个文件，否则访问权限将在7天后过期。我被告知不得发布或共享AlphaFold 3模型参数。
下载完Alphafold3的模型参数后，发现是一个名为af3.bin.zst的压缩文件，文件大小996MB。上传服务器后使用如下命令解压缩
zstd --decompress --force af3.bin.zst
至此，Alphafold3部署工作完成，之后就是研究一下并使用。