发表期刊：Nature Cancer
影响因子：23.177
测序方式：mRNA-seq、ChIP-seq、ATAC
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研究背景
SETD2是一种RNA聚合酶II (Pol II)相关的组蛋白甲基化转移酶，可催化H3K36me2的共转录甲基化，在活性转录基因中产生H3K36me3标记。研究发现，SETD2在透明细胞肾细胞癌（ccRCC）中突变的患病率很高（13%）。原发性ccRCC肿瘤的基因组图谱显示SETD2突变与转移呈正相关。然而，SETD2的缺失是否促进转移以及如何促进转移尚不清楚。
在本研究中，作者利用ATAC-seq、ChIP-seq和RNA-seq进行综合多组学分析建立了一个肿瘤抑制因子模型，在该模型中，SETD2介导的H3K36me3缺失激活增强子，通过调节染色质可及性来驱动致癌转录输出。此外，作者还发现了通过靶向特异性组蛋白伴侣复合物（包括ASF 1A/B和SPT 16）来治疗SETD2缺陷型癌症的基础策略。
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研究思路
图1 研究思路
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研究结论
本研究对RNA-seq、ATAC-seq和ChIP-seq数据的综合分析揭示了SETD2的表观遗传肿瘤抑制模型，其中SETD2介导的H3K36me3缺失创造了一个表观遗传景观，包括开放的染色质结构和活性的组蛋白修饰，使协同的致癌驱动因子能够进一步扩增转录输出。本研究阐明了SETD2的肿瘤抑制功能机制如何帮助发现治疗弱点，并为SETD2缺陷癌症提供可操作的治疗靶点。
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