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成功案例|血清代谢组和粪便宏基因组联合分析揭示肠道微生物相关代谢物的作用

成功案例|血清代谢组和粪便宏基因组联合分析揭示肠道微生物相关代谢物的作用 百易汇能
2023-01-11
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发表期刊:GUT

影响因子:31.793

测序方式:代谢组、宏基因组

研究对象:血清、粪便

01 研究背景

结直肠癌(CRC)在世界范围内已成为一个日益严峻的挑战,其早期诊断被认为是提高结直肠癌患者生存率的有效途径。结直肠癌的检测方法有多种,如粪便隐血试验(FOBT)、癌胚抗原(CEA)检测,以及结肠镜检查等。然而,由于无创试验的准确性较低和有创试验造成的损伤,这些方法的大规模使用受到了限制。因此,迫切需要一种无创、准确的CRC检测方法。在本研究中,作者结合血清代谢组学和粪便宏基因组学分析,发现一组与肠道菌群密切相关的血清代谢物。基于这些代谢物,开发了一组GMSMs,可以准确区分CRC和腺瘤患者。

02 研究思路

图1 研究思路

03 研究结论

在本研究中,作者通过血清非靶向代谢组学分析发现有885种血清代谢物在结直肠癌和腺瘤中都发生了显著改变,结合粪便宏基因组分析发现CRC相关的肠道微生物群会导致特定血清代谢物的改变。之后,作者通过靶向代谢组学筛选到了8种肠道微生物组相关的血清代谢物(GMSMs),能够准确地从正常样本中区分结直肠癌和腺瘤。通过GMSMs模型评估发现该模型优于CEA检测和FOBT/FIT筛查,可应用于CRC和腺瘤的检测。


END

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武汉百易汇能生物科技有限公司坐落于武汉光谷高农生物园总部,是一家专注于第二代、第三代测序技术在人类健康和生命科学研究两大领域的高新技术企业。公司现有软件著作60余项,发明专利6项;公司成立以来累计参与发表文章170余篇,其中包括Cell,Nature Genetics,PNAS,Food Chemistry等各领域顶级期刊。

【声明】内容源于网络
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百易汇能生物拥有二代测序平台、质谱平台及单细胞平台。为客户提供专业、高效的单细胞、基因组、转录组、微生物组、蛋白组、代谢组等服务。专注于高通量测序技术在医学健康和生命科学领域的应用,提供国内领先的基因测序服务。
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