景杰生物 | 报道
蛋白质翻译后修饰的众多生物学功能及其与多种疾病的紧密联系使其成为研究热点之一。但由于蛋白质的修饰丰度较低，与常规的蛋白质组学相比，修饰组学定量分析对样本量需求更高。而在许多实际应用场景中可获得的样本量十分有限，这也限制了修饰组学研究的开展。如临床穿刺活检组织样本、FFPE病理切片、小体积器官、通过流式细胞仪分选得到的微量细胞样本等，它们的蛋白量支持蛋白质组学检测，却很难进行修饰水平的定性与定量分析。因此针对微量样本的修饰组学检测技术路线亟需开发。
针对这一难题，景杰生物基于十几年的修饰组学沉淀与经验，进行不间断的技术升级与体系的全面优化，在微量修饰组学领域取得了重大突破。2022年率先推出适用于微量样本的一系列微量修饰组学，涵盖了磷酸化、乙酰化、泛素化、琥珀酰化、巴豆酰化、3-羟基丁酰化、2-羟基异丁酰化修饰等。考虑到乳酸化修饰广泛且重要的调控作用 (如肿瘤代谢、免疫调控、血管功能、神经调控)，更是于近期重磅推出微量乳酸化修饰。微量修饰组学非常适用于微少量样本的分析鉴定。以动物组织为例，先跟小编一起来看一下常规修饰与微量修饰样本量需求的差别吧~
图1 常规与微量修饰组学的动物组织送样标准
我司在降低样本量需求的同时，结合Bruker timsTOF Pro/Pro2高分辨率质谱仪，对技术路线进行持续优化，严格把控，实现了微量样本的高通量、高覆盖修饰组学分析。人组织FFPE样本微量乳酸化修饰鉴定深度接近900 (鉴定深度与样本类型有关)。微量巴豆酰化、2-羟基异丁酰化修饰整体鉴定参考深度3000。微量磷酸化修饰整体鉴定参考深度更是高达5000，为微量样本的修饰研究提供了坚实的保障。如果您想了解微量修饰产品和服务的更多信息，请扫描文末的二维码填写您的信息，或咨询景杰生物销售工程师，或拨打科服热线400-100-1145。
图2 微量乳酸化修饰内测数据 (500 μg肽段起始富集量)
临床活检样本仍是目前医学领域和疾病诊断中的重要样本来源，能够为医学及药物研究提供精确和有效的病理信息。基于活检样本开展修饰组学研究，可以充分利用罕见疾病或肿瘤等样本，实现不同生理病理状态下翻译后修饰水平的定量分析。为深入研究疾病发病机制、筛选疾病临床标志物、鉴定药物靶点提供重要基础，最终实现对疾病和特定患者进行个性化精准治疗的目的。
目前基于临床活检样本的蛋白质组学技术已广泛运用于癌症等疾病研究，极大的推动了疾病的临床过程和疾病机理研究。而蛋白质修饰组学研究较少，且多集中于磷酸化修饰组学。如柏林科学家对非小细胞肺癌FFPE穿刺活检样本进行了磷酸化修饰组学定量分析，为深入了解肺癌和其他类型癌症的发病机制提供了帮助[1]。日本科学家对内镜活检胃癌样本与正常胃粘膜样本进行了磷酸化修饰组学定量分析，发现癌组织中DNA损伤反应相关的通路显著富集，并通过分析激酶活性为精准医疗提供了有用的临床信息[2]。除了微量磷酸化修饰以外，还有更多的其它微量修饰如乳酸化修饰有待我们进一步挖掘。通过对临床活检样本进行无偏修饰组学分析，有望对疾病临床进程做出新的解释。
1. Nat Commun | 微量样本磷酸化修饰组学新方法研究助力肺癌研究
2. Theranostics | 胃镜活检癌组织样本的磷酸化组学分析
聚焦重要组织器官和生理功能系统研究、明确器官蛋白变化特征、阐释疾病调控和发展机制，对于精准医学意义重大。而小体积器官蛋白量有限，如小鼠视网膜蛋白量在1 mg左右，小鼠下丘脑蛋白量在0.5 mg左右，很难达到常规修饰组学送样标准。基于微量修饰组学的研究将为小体积器官研究提供重要视角。赵寅/李璐团队对视网膜组织进行磷酸化修饰组学分析，发现CXCR4 S355磷酸化参与TBK1介导的内皮屏障功能调控，为视网膜血管屏障功能障碍的发病机制与治疗思路提供了新的理论支持[3]。值得一提的是，候胜平团队对常氧和缺氧HMC3小胶质细胞进行乳酸化修饰组学分析，发现乳酸/p300/YY1乳酸化/FGF2转录轴参与缺氧诱导的视网膜新生血管形成[4]。鉴于修饰组学与疾病的密切联系，微量修饰尤其是微量乳酸化修饰的推出，将为小体积器官的深入研究提供理论支撑与帮助。
Cell Death Discov | 磷酸化修饰组揭示TBK1影响视网膜血管发育及功能新机制
微量修饰组学可以提供人体或小鼠等动物模型整个生命周期，特别是幼龄时期组织的蛋白质修饰定量，深入揭示翻译后修饰的变化与婴幼儿疾病/发育的密切联系。这对于深入了解生命现象的本质、疾病发生机理、疾病诊断乃至药物开发有着巨大的意义[5]。此外，蛋白量较少的细胞样本也可进行微量修饰组学的检测，实现生理或病理过程相关蛋白质修饰的高精度动态定量分析。
综上所述，景杰生物结合常规修饰组学的领先优势，率先推出微量修饰组学服务。能够实现临床穿刺活检组织样本、FFPE病理切片、小体积器官等多种微量样本的定性和高深度定量分析。建立了从常规修饰组学到微量修饰组学这一完善的蛋白质组学平台，满足不同研究人员的多种实验需求。
蛋白质翻译后修饰文献合集
乳酸化修饰 O-糖基化修饰 巴豆酰化修饰 N-糖基化修饰 琥珀酰化修饰 磷酸化修饰 2-羟基异丁酰化修 乙酰化修饰 3-羟基丁酰化修 泛素化修饰 丙二酰化修饰 氧化还原修饰 SUMO化修饰 苯甲酰化修饰
不同研究领域文献合集
肿瘤研究专题 心脑血管专题 代谢性疾病专题 神经科学专题 阿尔兹海默症专题 动物科学专题 植物科学专题 表观遗传调控专题 药学专题 中医药专题 毒理研究专题 食品营养专题 生态环境专题 微生物专题
其他领域文献合集
景杰生物项目合作文章 蛋白质/修饰图谱 蛋白组合作文章 科研热点 血液蛋白质组学 单细胞蛋白质组学 空间蛋白质组学 4D蛋白质组学 多组学专题 CNS期刊文献精选 蛋白组大咖文献精选 高分综述精选 专家视界
1. Corinna Friedrich, et al., 2021. Comprehensive micro-scaled proteome and phosphoproteome characterization of archived retrospective cancer repositories. Nature Communications.
2. Yuichi Abe, et al., 2020. Comprehensive characterization of the phosphoproteome of gastric cancer from endoscopic biopsy specimens. Theranostics.
3. Bowen Zhao, et al., 2022. Endothelial deletion of TBK1 contributes to BRB dysfunction via CXCR4 phosphorylation suppression. Cell Death Discovery.
4. Wang X, et al., 2023. YY1 lactylation in microglia promotes angiogenesis through transcription activation-mediated upregulation of FGF2. Genome Biology.
5. Sriram Aravamudhan, et al., 2021. Phosphoproteomics of the developing heart identifies PERM1 - An outer mitochondrial membrane protein. Journal of Molecular and Cellular Cardiology.
景杰生物作为修饰组学领域的领跑者，拥有多种修饰抗体和修饰组学质谱检测服务。如果您想了解相关产品和服务的更多信息，请扫描下方二维码填写合作咨询表单、或咨询景杰生物销售工程师、或拨打科服热线400-100-1145。
