在本系列的前两期文章中，我们首先深入探讨了“激酶分析”这一精准的研究工具（点击链接阅读：每周一节生信实操课1：激酶活性预测分析），接着我们了解了如何通过“GSEA分析”（基因集富集分析）来宏观把握基因表达变化的整体情况（点击链接阅读：每周一节生信实操课2：GSEA富集分析）。
本期文章，我们将带领大家深入了解景杰生物特有的蛋白质组学/修饰组学数据分析工具：全流程分析工具，此工具实现了一键生成分析报告，并附带相关生信分析图文结果。那么它主要包含什么分析内容，具体又如何使用呢？让我们一起来学习体验~
“全流程分析”这个工具是针对蛋白质组学/修饰组学设计的全流程分析工具，集成了景杰生物标准分析流程的关键模块，包括蛋白功能注释、差异分析、功能富集、功能聚类、蛋白互作网络等。通过这个工具，您可以进行全流程分析，调整差异蛋白筛选阈值和功能富集背景。自上线以来，该工具一直备受欢迎，使用量位居前列。
为了扩大这个工具的应用范围，更好地支持老师们的科研工作，这次更新我们增加了许多的实用功能，包括样本名称修改、样本分组调整、比较组修改、差异蛋白重新计算、以及差异统计方法更改等。接下来就让我们一起来看看这些新功能如何帮助您更轻松地进行分析吧！
1.上传蛋白表达谱文件和分组文件，具体格式可参数示例文件。选择注释文件夹（可在生物信息学标准分析报告的“生物信息学方法”部分找到），并选择项目类型和其他参数。若在景杰做过组学项目，可直接输入项目标准分析中“2-Basic_analysis”文件夹下MS_identified_information.txt和repeat_list文件。
2.确认参数后，点击提交分析。分析完成后，可自定义文件名并下载结果。
更多分析数据及结果可试用工具后下载查看。如果你在使用中遇到任何问题，可在工具内查阅使用教程。更多更全的结果解读可在云平台的“云资源”部分，通过“定量/定性网页版生物信息分析文档说明-2023版”查看。
本期就为大家介绍到这里，欢迎点击下方云平台链接操作体验。下期我们将推出“探秘景杰云新功能系列4：绘出科学新高度，多款科研绘图工具全新发布”，请持续关注~
景杰云平台现已上线50+云工具，配套相关视频教程和说明文档，如果您想要了解更多信息，欢迎访问景杰生物云平台 ：https://ptm-biolab-css.com.cn/cloudIndex，免费注册登录后即可畅享全部功能，祝大家可以通过景杰云获得更好的研究成果和使用体验！
作为蛋白质组学领域的科研工作者，我们会不断地进行更新优化，充分利用景杰云，持续提供更全面、更高效的技术支持与服务，提高广大用户的科研效率！更多好用工具持续上新中，敬请关注！
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