人工智能辅助药物设计领域科研进展与药企动态周报
聚焦QSAR、分子对接、靶标动力学及小分子调节剂等前沿研究，涵盖药企重大研发动态与行业会议信息
科研进展
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2024年11月8日【QSAR】ACS Omega | 喹唑啉衍生物作为有效的EGFR抑制剂用于肺癌治疗的设计和优化：综合QSAR，ADMET和分子模型研究
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2024年11月8日【分子对接】J. Chem. Inf. Model. | DSDPFlex：灵活的接收器对接与GPU加速
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2024年11月7日【药物靶标】J. Chem. Theory Comput. | 药物靶标动力学里程碑模拟的进展与挑战
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2024年11月7日【小分子调节剂】J. Med. Chem. | 靶向辅助激活子相关精氨酸甲基转移酶1（CARM1）的小分子调节剂作为癌症治疗的治疗剂：当前的药物化学见解和新兴机会
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2024年11月5日【SARS-CoV-2】Anal. Chem. | 基于位点特异性标记技术的新型无细胞和无病毒的SARS-CoV-2中和抗体ELISA
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2024年11月5日【图神经网络】J. Chem. Inf. Model. | ChemXTree：一种用于ADMET预测的特征增强图神经网络神经决策树框架
1.【QSAR】
表皮生长因子受体（EGFR）是肺癌治疗的重要靶点。本研究基于31种喹唑啉衍生物进行2D-QSAR分析，结合主成分分析（PCA）与多元线性回归（MLR），构建了高预测能力模型（R² = 0.745，R²_test = 0.941）。基于该模型，研究人员设计出18种新分子，其中Pred15、Pred17、Pred20和Pred21在分子对接中表现出对EGFR的高亲和力。MD模拟进一步验证了Pred17、Pred20和Pred21的稳定性与结合模式，ADMET预测显示其具备优良药代动力学特性。该研究为新型肺癌抑制剂的开发提供了理论支持与候选分子。
2.【分子对接】
分子对接在药物发现中至关重要，但传统方法难以兼顾精度与效率。DSDPFlex是一种基于GPU加速的灵活受体对接新方法，通过优化采样、评分与搜索空间，显著提升计算性能。在交叉对接测试中，DSDPFlex精度优于AutoDock Vina，在柔性受体任务中速度提升达100倍。该方法在apo结构与AlphaFold2预测结构的筛选中表现优异，适用于虚拟筛选与高通量对接研究，有望推动基于结构的药物设计发展。
3.【药物靶标】
分子动力学模拟虽广泛应用，但在捕捉药物靶标罕见事件方面存在局限。里程碑模拟通过将相空间划分为离散状态，可扩展时间尺度，揭示靶标动态行为。本文综述了该方法在药物靶标动力学中的应用进展，探讨了马尔可夫里程碑与Voronoi镶嵌的改进策略，并聚焦于解结合速率常数的计算挑战。该方法为理解药物作用机制、优化结合动力学提供了新路径，助力更高效的药物设计。
4.【小分子调节剂】
辅助激活子相关精氨酸甲基转移酶1（CARM1）过表达与多种癌症密切相关，已成为抗癌药物研发的重要靶点。然而，传统抑制剂面临疗效有限、耐药及无法抑制非酶功能等问题。本文系统回顾了CARM1的结构与生物学功能，总结了同型选择性抑制剂、双靶点抑制剂、PROTAC降解剂及激活剂等新型调节策略的最新进展，并分析了其药效学、药代动力学特征与临床现状，展望了未来药物开发方向。
5.【SARS-CoV-2】
为应对SARS-CoV-2快速变异，研究团队开发了一种无细胞、无病毒的中和抗体ELISA（NAb-ELISA），基于RBD与ACE2结合的竞争抑制原理。通过生物素化hACE2-Fc-Avi蛋白捕获与HRP标记RBD探针检测，该方法在野生型与Delta型血清评估中与假病毒中和试验（pVNT）高度相关（R² > 0.90）。该平台可有效筛选中和单抗，并快速适配新突变株检测，为疫苗评估与抗体药物开发提供高效、安全的替代方案。
6.【图神经网络】
ChemXTree是一种融合门控特征调制单元（GMFU）与神经决策树（NDT）的新型图神经网络模型，专用于ADMET性质预测。在MoleculeNet及多个药物数据库上的测试表明，ChemXTree性能优于现有主流模型，潜空间可视化显示其显著提升底物与非底物的分类能力。该模型为分子性质预测提供了更精准的深度学习框架，助力药物候选物的高效筛选与优化。
药企动态
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2024年11月9日【Autolus Therapeutics】首款无需REMS的CAR-T疗法获FDA批准
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2024年11月8日【迪哲医药】中国原创新药舒沃替尼片申报美国上市
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2024年11月7日【维立志博】超6亿美元支持“first-in-class”三特异性抗体开发
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2024年11月7日【再生元】Dupixent获欧盟批准用于儿童嗜酸性食管炎
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2024年11月6日【艾伯维】CD3/CD20双抗艾可瑞妥单抗在华申报上市
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2024年11月6日【首药控股】终止BTK抑制剂SY-1530在非霍奇金淋巴瘤中的开发
1.【Autolus Therapeutics】
美国FDA已批准Autolus Therapeutics的Aucatzyl（obe-cel）用于治疗复发或难治性B细胞急性淋巴细胞白血病（r/r B-ALL）成人患者。该疗法为全球首个无需风险评估与缓解策略（REMS）的CAR-T产品，标志着CAR-T治疗在安全性与可及性上的重要突破。
2.【迪哲医药】
迪哲医药自主研发的EGFR exon20ins靶向药舒沃替尼片（舒沃哲®）已向美国FDA提交新药上市申请，拟用于治疗经含铂化疗进展的局部晚期或转移性非小细胞肺癌患者。该药为中国原研创新药，此次申报标志着国产靶向药进军国际市场的关键一步。
3.【维立志博】
维立志博与Aditum Bio合作成立Oblenio Bio，推进其潜在“first-in-class”CD19/BCMA/CD3三特异性抗体LBL-051的临床开发。该合作获得超6亿美元资金支持，旨在加速针对自身免疫性疾病的创新疗法研发。
4.【再生元】
再生元与赛诺菲联合开发的Dupixent（dupilumab）获欧盟批准用于1至11岁嗜酸性食管炎（EoE）患儿，成为欧盟首个获批用于该人群的EoE治疗药物，显示出持续一年以上的疗效。
5.【艾伯维】
艾伯维的CD3/CD20双抗艾可瑞妥单抗（epcoritamab）已在中国申报上市。该药由Genmab利用DuoBody技术开发，可激活T细胞杀伤CD20阳性B细胞，用于治疗B细胞淋巴瘤，已在多个国家获批。
6.【首药控股】
首药控股决定终止BTK抑制剂SY-1530在复发/难治性套细胞淋巴瘤等非霍奇金淋巴瘤中的临床开发，以优化资源分配。公司未来将探索该分子在其他适应症中的潜在价值。
会议信息
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首届中国药谷 · 未来生物创新药论坛 主办单位：中关村科技园区大兴生物医药基地管理委员会 会议时间：2024年11月15-16日 会议地点：北京 会议主旨：汇聚行业专家与企业代表，探讨创新药前沿趋势，推动医药健康要素融合，打造全球首创药落地首选地。 -
ICGT第八届细胞与基因治疗深度聚焦峰会 会议时间：2025年1月9-10日 会议地点：上海 会议主旨：聚焦细胞与基因治疗产业链关键环节，涵盖细胞免疫、眼科、罕见病与CMC等热点议题，共谋产业黄金十年发展路径。 -
SIT 2025第七届小分子药物创新峰会 主办单位：上海恺默信息咨询有限公司 会议时间：2025年3月27-28日 会议地点：上海 会议主旨：聚焦减重药物、多肽药物进展与不可成药靶点突破，探讨小分子药物创新路径与前沿技术策略。
