论文介绍了 Trimmomatic，这是一款灵活、高效的下一代测序 (NGS) 数据预处理工具，特别针对 Illumina 测序数据。 作者开发此工具是为了满足现有工具在处理配对末端数据时的灵活性和性能需求。文章讨论了 Trimmomatic 用于移除技术序列（如适配器）和质量过滤的不同算法，包括“简单模式”和“回文模式”用于适配器移除，以及“滑动窗口”和“最大信息量”用于质量过滤。研究结果表明，预处理显著提高了参考比对和从头组装的质量，尤其是在处理低质量数据时，并且 Trimmomatic 在性能上优于其他同类工具。
