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RNA提取方法 了解一下!

RNA提取方法 了解一下! 杭州博日科技
2018-07-24
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导读:RNA提取方法汇总RNA提取是分子生物学研究中最基础的实验之一,但RNA相比较DNA而言,因其易降解,经常让... ...
RNA提取方法汇总

RNA提取是分子生物学研究中最基础的实验之一,但RNA相比较DNA而言,因其易降解,经常让新手哭笑不得。

RNA易降解原因

内因:RNA因其自身特殊结构,本身不稳定,另外RNA分子2’位置上有游离的羟基,易形成2’,3’-环形磷酸盐中间产物,易分解。

外因:生物体内和外部环境中存在大量RNase,并且RNase不易失活。

炎炎夏日,何种方法能快速获取RNA呢?


Trizol法

Trizol是一种传统总RNA抽提试剂,内含含有酚、异硫氰酸胍和β-巯基乙醇等物质,能迅速破碎细胞,抑制细胞释放出的核酸酶。酚能使核蛋白质与核酸解聚;异硫氰酸胍是一类强力的蛋白质变性剂,使蛋白质二级结构消失,细胞结构降解,核蛋白迅速与核酸分离;β-巯基乙醇主要破坏RNase蛋白质中的二硫键。

实验步骤
01

实验准备

(RNA专用枪头、EP管、PBS、Trizol、氯仿、异丙醇、75%乙醇、DEPC水(0.1%等)

02

样本处理

(加入对应比例的Trizol组织液氮研磨后匀浆、培养细胞可直接收集)

(原则:确保裂解液能够彻底样本,保持溶液中核酸浓度适中)

03
氯仿萃取

离心后分三层:上层为水相的RNA;中层为DNA,脂类等;下层为细胞残渣,蛋白,多糖等。

04

转移水相

转移水相时,枪尖随着液面下移而下移,避免扰乱分层,慢慢吸取,避免吸到中间相和下层有机相。


05
异丙醇沉淀

加入等体积的异丙醇,混匀,静置10分钟后,4℃,12000g离心10分钟。

06

乙醇洗涤

加入75%乙醇时轻轻加进去就好,避免把RNA沉淀吹散,RNA吹散后很难通过离心聚集到一起成为肉眼可见的沉淀,导致实验的失败。

07

RNA溶解
08
RNA浓度检测
09
电泳检测
柱式试剂盒法

1、国内外知名厂家试剂盒法

配制Carrier RNA与裂解液的混合液

Carrier RNA与裂解液混合后最多保存48小时,现配现用,成本高且操作繁琐

样本前处理

室温孵育(10分钟)

离心后加入无水乙醇

混合物过离心吸附柱

两次洗涤

室温晾干

RNA洗脱


2、博日SimplyP 系列RNA提取试剂盒

样本前处理

室温孵育(2分钟)

两次洗涤

室温晾干

RNA洗脱


7分钟快速提取



贴壁细胞RNA提取-荧光检测


1%琼脂糖凝胶电泳图和RNA浓度、纯度检测结果


用BioEasy Master Mix (SYBR Green)做荧光定量PCR检测







   RNA纯度和完整度判断

浓度检测:

OD260/OD280:1.8-2.2

OD260/OD230:1.5-2.2

①   OD260/OD280 低于 1.8 表示有蛋白质的污染 ;

②   OD260/OD230 低于 1.5 表明有明显的有机物如糖、肽、苯 酚等的污染。


电泳检测:

1、RNA电泳共3条条带,分别是28s、18s、5s。且第一条带(28s)亮度应为第二条(18s)亮度的约2倍。最下面一条带最淡,为5s条带。如果5s条带很亮,28s和18s不亮,说明RNA发生严重降解  

2、除了观察电泳条带亮度以外,要关注条带拖尾现象,全泳道弥撒,则为存在杂质或者降解

不同方法提取RNA优缺点对比


杭州博日科技有限公司是一家专业从事生命科学仪器和试剂研发、生产、销售及服务的企业。

仪器以及试剂种类众多,详情请咨询:0571-87774319

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杭州博日科技股份有限公司(BIOER)是一家专业从事生命科学仪器和试剂研发、生产、销售及服务的企业。主营PCR仪系列产品,还推出了一系列恒温金属浴、核酸提取系统、标准PCR实验室、恒温培养箱、凝胶电泳仪、恒温水槽等相关匹配产品。
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