“PNAS∣极限的甲烷氧化菌,500 ppm甲烷浓度下即可快速生长”
文献信息: 
Lian He, Joseph D. Groom, Erin H. Wilson, Janette Fernandez, Michael C. Konopka, David A. C. Beck, and Mary E. Lidstrom.
https://doi.org/10.1073/pnas.2310046120
PNAS 影响因子:12.779
背景介绍
大气中强温室气体CH4的含量迅速增长,去除甲烷的一种方法是利用甲烷氧化菌,这种细菌可以将CH4转化为CO2和生物质。通常,甲烷氧化菌需要在5000到10000 ppm左右的CH4环境下生长,但大气中的CH4仅有1.9 ppm。垃圾填埋场、厌氧消化废水、水稻废水、油气井等排放场所上方的空气中含有的甲烷也才只有500 ppm。因此,需要开发可以在500 ppm或更低CH4浓度下生长的甲烷氧化菌。
在这里,作者报道了一些可以在500 ppm浓度CH4生长良好的甲烷氧化菌,其中一株菌Methylotuvimicrobium buryatense 5GB1C甚至可以保持较高的氧化速率。基于生物反应器的性能和转录组学分析,这种细菌可以在极低的生长浓度下保持较高能量维持,且具有极高的CH4亲和力。
在甲烷排放场所中,该菌是极佳的可利用菌种之一。
图文解读

图1 在500 ppm浓度CH4下,各菌株的生长性能
(a-f)7个甲烷氧化菌的生长情况。
(g)7个甲烷氧化菌在14天内平均的日生长情况。

图2 M. buryatense 5GB1C的生长特征和生长动力学常数
(a)不同CH4浓度条件下,菌株相对应的生长速率。
(b)菌株生长速率和CH4氧化速率的线性关系。
(c)初始CH4浓度对菌株氧化CH4速率的影响。
(d)初始CH4浓度和CH4氧化速率的线性关系。

(a)全部基因组的转录组学对比。
(b)中心碳代谢过程的转录组学对比。
(c)能量过程的转录组学对比。
(d)细胞组装模块的合成和辅因子的转录组学对比。
(e)翻译和转录水平的转录组学对比。
(f)运动和趋化性的转录组学对比。
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