NAT COMMUN ∣ 人工孢子化的大肠杆菌,用于高效的界面生物催化
文献信息:

作者:Zhiyong Sun, René Hübner, Jian Li, Changzhu Wu
发表时间:06 June 2022
https://doi.org/10.1038/s41467-022-30915-2
Nature Communications 影响因子:16.6
背景介绍
细菌在极端环境下能形成休眠孢子,外层由多层保护壳包裹,可抵御紫外线、高温和化学攻击,使遗传物质长期存活。受此启发,研究者尝试在普通细胞外“披”上一层人工外壳,构建“人工孢子”,让细胞既保持活性,又获得类似孢子的耐久力,从而用于全细胞催化。然而,过去的人工孢子只能包裹少数几种天然微生物,且依赖其内源酶,种类有限、活性受限,尚未成为一种普适的合成平台。
最新研究突破了这一局限:以大肠杆菌这一最常用的基因工程底盘为基础,在其表面均匀包覆一层聚多巴胺,几分钟内即可形成厚度约40 nm的“盔甲”。这层外壳赋予细胞三重能力:
1. 耐受极端条件——紫外线照射2小时、高温或有机溶剂处理下,存活率仍超80%;
2. 稳定水-油乳液——人工孢子自发吸附在油滴表面,形成微米级“Pickering乳液”,反应界面面积扩大数百倍;
3. 兼容多种反应——既能表达单一重组酶,也能在同一细胞内共表达多酶级联,甚至可与钯纳米颗粒等化学催化剂协同,完成化学-酶促串联反应。
由此,一个简单、通用且可规模化的“细胞工厂”平台诞生:任何可在大肠杆菌中表达的酶,都能借助人工孢子在极端或两相体系中持续催化,为药物、精细化学品及能源分子的绿色合成提供了新思路。
图文解读

图1 大肠杆菌(E. coli)细胞作为人工孢子用于界面生物催化的涂层示意图
ADH:醇脱氢酶;CalB:南极假丝酵母脂肪酶B;Pd:钯。

图2
a) 大肠杆菌细胞上人工孢子形成的示意图。
b, c) 不同放大倍数下原始大肠杆菌细胞的横截面明场透射电子显微镜(TEM)图像,以及
e, f) 不同放大倍数下人工孢子的图像。
d) 原始大肠杆菌细胞和
g) 人工孢子的扫描电子显微镜(SEM)图像。

图3
a) 原始大肠杆菌细胞和
b) 人工孢子的活/死测定;绿色 – 活细胞;红色 – 死细胞。
c) 原始大肠杆菌细胞(绿色曲线)和人工孢子(蓝色曲线)的生长曲线。
(c)的结果为三次平行实验的平均值。误差条表示三次平行测量的标准偏差,n = 3。

图4
a) 未涂层大肠杆菌细胞和人工孢子在紫外线(UV)照射下的示意图。
b) 未涂层细胞和c) 人工孢子在UV处理2小时后的活/死测定;绿色 – 活细胞;红色 – 死细胞。
d) 苯甲醛裂解酶(BAL)在UV处理下的稳定性;蓝色柱 – 人工孢子;绿色柱 – 未涂层细胞。
e) 未涂层细胞和人工孢子在界面应力(即甲苯-水双相条件)下的示意图。
f) 未涂层细胞和
g) 人工孢子在界面应力处理2小时后的活/死测定;绿色 – 活细胞;红色 – 死细胞。
h) BAL在界面应力下的稳定性;蓝色柱 – 人工孢子;绿色柱 – 未涂层细胞。
(d, h)的结果为三次平行实验的平均值。误差条表示三次平行测量的标准偏差,n = 3。

图5
a) 乳液制备示意图。
b) 乳液在0小时和24小时的外观。
c) 乳液的光学显微镜图像。
d) 油包水乳液的共聚焦激光扫描显微镜(CLSM)图像;红色 – 有机相,绿色 – 水相。
e) 含绿色荧光蛋白(GFP)的人工孢子稳定的乳液滴plet示意图。
f) 单个乳液滴plet的CLSM图像和
g) 由含GFP的人工孢子稳定的乳液的CLSM图像。
h) 单个乳液滴plet表面的扫描电子显微镜(SEM)图像。

图6
a) CalB催化的模型酯化反应。
b) 不同油水比乳液的酶活性(左侧纵轴)和表面积(右侧纵轴,蓝色曲线)。
c) 来自人工孢子乳液(蓝色)、硅颗粒乳液(黄色)和未乳化双相系统(绿色)的CalB反应曲线。
d) 人工孢子的重复使用。
e) BAL催化的苯偶姻缩合反应。
f) 在人工孢子乳液(蓝色)和双相对照(绿色)中的BAL催化反应曲线。
g) 在人工孢子内烟酰胺腺嘌呤二核苷酸氢(NADH)再生用于乙酰苯胺还原反应,烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD⁺)为氧化型。
h) 在人工孢子乳液(蓝色)和双相对照(绿色)中的ADH-a催化反应曲线。
(b–d, f, h)的结果为三次平行实验的平均值。误差条表示三次平行测量的标准偏差,n = 3。

图7
a) 使用嗜热杆菌醇脱氢酶(ADH-ht)和CalB的级联反应。
b) 在人工孢子乳液(蓝色)和双相对照(绿色)中的反应曲线;插图是CLSM拍摄的乳液图像;红色 – 有机相,绿色 – 水相。
c) 使用ADH-ht和BAL的级联反应,以及
d) 在人工孢子乳液(蓝色)和双相对照(绿色)中的反应曲线;插图是CLSM拍摄的乳液图像;红色 – 有机相,绿色 – 水相。
(b, d)的结果为三次平行实验的平均值。误差条表示三次平行测量的标准偏差,n = 3。

图8
a) 载钯纳米颗粒(Pd-NPs)的人工孢子(Pd@AS)的示意图。Pd-NPs:钯纳米颗粒。
b) Pd@AS横截面的高角环形暗场扫描透射电子显微镜(STEM)图像。
c) 基于STEM-EDXS的Pd(粉色)元素分布图。EDXS:能量色散X射线光谱。
d) 人工孢子的生长曲线;插图显示其在琼脂平板上的生长。
e) Pd@AS形成乳液的示意图。
f) 由Pd@AS稳定的乳液的共聚焦激光扫描显微镜(CLSM)图像;红色 – 有机相,绿色 – 水相。
g) Pd纳米颗粒和CalB催化的化酶级联反应方案,以及
h) 在人工孢子乳液(蓝色)和双相对照(绿色)中的反应曲线。
(d, h)的结果为三次平行实验的平均值。误差条表示三次平行测量的标准偏差,n = 3。
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