Plant and Animal Genome Conference(PAG 动植物基因组大会)是全球规模最大、影响力最高的农业基因组学盛会,每年在美国圣迭戈举办。大会汇聚来自植物、动物、育种、基因组学、表观遗传和多组学等领域的顶尖学者与产业力量,通过 plenary、workshop、poster 与展台交流展示最新科研成果与技术进展,是全球农业基因组研究者最重要的国际交流平台。
贝纳基因作为亚太地区最大的纳米孔测序中心,一直致力于基于 ONT 平台的长读长测序与多组学整体方案研发。在 ONT 超长读长测序、Direct RNA Sequencing(DRS)、Pore-C、单细胞全长转录组以及 Direct lncRNA 测序等方向,积累了大量实战经验与方法创新,将单一测序手段升级整合为可落地的长读长多组学解决方案。
截至目前,贝纳基因已完成 10 万+ 测序样本,单日峰值产量可达 6.9 T,服务科研用户超过 3000 家。此次受邀参加 PAG 大会,我们也将把多年的长读长实践经验与典型项目系统呈现,与全球研究者面对面交流与分享。
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NO.1
活动信息
报告主题:ALL in ONT——超长读长驱动的高质量基因组与多组学解决方案
报告人:
苏晓俊 博士
贝纳基因 高级科学家
会议领域:植物与动物基因组学、作物育种、动物遗传改良、多组学研究
会议地点:美国圣迭戈(San Diego, CA)
参会形式:大会专题报告 + 展台技术交流
展台信息:Sailgene展台(贝纳基因全资子公司,展台号:Booth #424)
https://nanoporetech.com/about/events/conferences/pag-2026
贝纳基因作为亚太地区最大的 ONT 测序服务商,将在会议中分享超长读长驱动的高质量基因组与多组学方案。
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报告亮点
系统展示“ALL in ONT”整体技术路线:从超长读长基因组组装、T2T 组装到多组学一体化分析。
多物种、多案例实战数据,涵盖粮食作物、经济作物、林木、家畜、水产及昆虫等重要物种。
重点解析棘手样本解决方案:包括富多糖多酚植物组织、野外采集样本、博物馆样本等。
分享 TAIL Iso-seq、全长 lncRNA 测序、Direct RNA/lncRNA-seq、SMAC-seq 等 ONT 多组学应用。
展示如何在同一技术平台上打通基因组、表观遗传、染色质三维结构与全长转录组信息。
PART 03
技术亮点概览
1. 超长读长基因组组装与 T2T 组装
贝纳基因长期专注于基于牛津纳米孔(Oxford Nanopore Technologies, ONT)的超长读长测序,在纯 ONT 基因组组装、T2T(端粒到端粒)组装和泛基因组构建方面积累了丰富项目经验。通过结合 Pore-C / Hi-C 等 3D 基因组技术,可将 contig 精确提升至染色体水平,在多种物种中实现高 contig N50、优良 BUSCO 完整度和可靠 QV 评分。
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2. 困难样本与“非理想材料”的高质量
基因组解决方案
针对富多糖、多酚或存在一定降解与交联的复杂样本,贝纳基因建立了可广泛推广的超长 DNA 提取与质控流程,在多个项目中稳定获得 50–150 kb 甚至 >200 kb 的超长读长,为高难度样本的高质量基因组组装提供了可靠实验基础。
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3. ALL in ONT 多组学矩阵
在转录组与表观遗传层面,贝纳基因围绕 ONT 平台打造了完整的多组学技术矩阵:TAIL Iso-seq 可同时解析全长转录本和 poly(A) 尾长度,助力 APA 与农艺性状研究;全长 lncRNA 测序有助于精准刻画非编码 RNA 的结构和功能;Direct RNA/lncRNA-seq 能够直接读取原生 RNA 分子并保留部分修饰信息;SMAC-seq 等技术则可在单分子、单倍型水平上解析染色质可及性、核小体定位与 DNA 甲基化等表观遗传特征。
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关于贝纳基因
贝纳基因是一家专注于长读长测序与多组学整体解决方案的科技公司,致力于为全球科研团队提供从实验设计、样本处理、测序执行到数据分析与结果解读的一站式服务。公司业务广泛覆盖植物、动物、微生物及多种特殊物种类型,尤其在超长读长基因组组装、T2T 组装、泛基因组构建和基于 ONT 的多组学研究方面具有显著优势。
依托稳定成熟的实验体系与经验丰富的生信团队,贝纳基因已参与多个高水平合作项目,协助合作伙伴在作物遗传改良、动物育种、生物多样性保护及复杂性状解析等方向取得重要进展。
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贝纳基因使用Nanopore平台完成全球第一个大型复杂植物基因组(菊花基因组)的组装和后续分析工作。提出并推动千种本草基因组计划,并构建药用植物基因组数据库,推动药材研究的发展。
贝纳基因使用Nanopore平台完成数千份细菌基因组、宏基因组测序和数据分析;完成数千份全长转录组和Direct转录组测序及分析。提出并推动基于Nanopore测序的万种微生物基因组完成图计划和十万人的Nanopore宏基因组研究计划。
贝纳基因开发了基于Nanopore平台的微生物检测体系,自主开发的数据库涵盖现已正式发表的所有微生物基因组,大型测序仪单机一次运行可以产生7.2T数据,小型便携式测序系统可用于临床检测和野外作业。
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