秋季，是猕猴桃施用有机肥的黄金时间。有机肥料能为农作物提供全面营养，改良土壤结构，增强土壤的保肥供肥与缓冲能力，对增产具有重要的作用。但有机肥成分复杂，在施肥时做到合理尤为重要。
（堆肥）
有机肥应充分腐熟后施用
一些动物粪便如猪牛栏肥以及人粪尿未经发酵腐熟直接施入土壤，这些未经腐熟的有机肥在土壤中经微生物分解发酵，产生的氨气容易引发作物烧根、中毒，有的还会滋生杂草和传播病虫害。
因此，应将其充分发酵后施用，并提倡在田边地头建贮粪池发酵的方法，或者将堆肥堆积加水湿润，用泥土封住，使其温度达到35℃～40℃，经过25～30天即可发酵完毕，高温法将粪肥在60℃条件下充分发酵，可杀灭其内的虫卵和杂草种子，施用时更安全有效。
但在实际生产中很多猕猴桃种植户不合理施用有机肥，要么没有起到作用，要么危害猕猴桃。具体表现在以下几个方面：
第一，施用未腐熟的有机肥，在土壤中会自然发酵，产生热量，出现烧根的现象；未腐熟有机肥中含有大量虫卵和病菌，来年气温回升，土壤中虫害、病害增加。
使用没有腐熟的谷壳，出现烧根现象
翻地后将有机肥撒施在土表
第三，有机肥使用过晚。休眠期使用有机肥，会挖断部分根系，此时根系停止活动，断口难以愈合且不会生长新根，影响第二年春季根系对养分的吸收。
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