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41-Moderna揭秘LNP“出芽”(Bleb)内的真实"住客"——mRNA

41-Moderna揭秘LNP“出芽”(Bleb)内的真实"住客"——mRNA 绿绵科技
2025-12-02
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导读:硫堇(Thionine)作为“分子探针”,在低温电子显微镜(Cryo-EM)下成功“点亮”了mRNA的位置。研究突破性地发现,mRNA并非总是与脂质紧密混合,而常常存在于一个充满溶剂的、独立的“出芽”


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深度解读

在本系列的前几篇文章中,我们已经了解到,无论是外部环境压力还是内部脂质的“不匹配”,都可能导致LNP表面形成“Bleb”结构。这自然引出了我们心中最大的疑问:这个神秘的“小房间”里,到底装了什么?今天,Moderna的科学家们将用“眼见为实”的证据,通过一把精妙的“分子钥匙”,首次为我们打开这个房间的门,揭示mRNA的真实“住所”。今天,我们就聚焦一篇发表于《Biophysical Journal》的重磅研究,由Moderna 公司的Mark L. Brader 与Lin Jin 团队带来的:“Encapsulation state of messenger RNA inside lipid nanoparticles”。

这项工作可谓是为当前最火热的mRNA递送技术提供了一块“纳米级罗塞塔石碑”。它解决了一个领域内长期悬而未决的核心痛点:mRNA分子在脂质纳米粒(LNP)这个复杂的“房子”里,究竟“住”在哪个房间?研究团队另辟蹊径,巧妙地使用了一种能渗透LNP并特异性结合mRNA的阳离子染料——硫堇(Thionine)作为“分子探针”,在低温电子显微镜(Cryo-EM)下成功“点亮”了mRNA的位置。研究突破性地发现,mRNA并非总是与脂质紧密混合,而常常存在于一个充满溶剂的、独立的“出芽”(Bleb)结构中。这一发现颠覆了部分传统认知,为理解LNP的稳定性、释放机制乃至优化mRNA疫苗的设计提供了前所未有的直观依据。

图1. 工欲善其事,必先利其器:验证“分子探针”的可行性

在揭开谜底之前,科学家首先需要证明他们选择的“钥匙”——硫堇染料,是可靠且有效的。这张图就完美地回答了两个关键问题:

  • 探针能准确识别目标吗? 图1a和1b通过热力学和光谱学分析,清晰地表明硫堇染料能够与mRNA发生强烈的、特异性的结合。这种结合会引起染料光谱的显著变化,这就像一个明确的信号,告诉我们:“是的,我找到mRNA了”。

  • 探针能进入LNP内部吗? 更关键的是,这个探针必须能够穿透LNP的脂质外壳,到达mRNA所在的内部空间。图1c的动力学曲线显示,当LNP被加入到硫堇溶液中时,光谱信号会随时间发生变化,最终达到平衡。这有力地证明了硫堇分子正在逐步渗透进入LNP内部并与mRNA结合。

最后,图1d确认了加入染料后,LNP的大小和表面电荷没有发生显著变化,确保了这项观测技术不会破坏LNP本身的结构,保证了后续观察结果的真实性。至此,一把能够进入LNP“房间”并能点亮mRNA的“钥匙”已经准备就绪。

图2. 拨云见日:首次“点亮”并定位mRNA在LNP中的真实位置

这是本研究最核心、最震撼人心的部分。研究团队利用已经验证过的硫堇染色法,对不同形态的LNP进行了Cryo-EM成像,直接“看”到了mRNA的“住所”。

  • 惊人的发现:mRNA的“独立套间”:在图3a中,对于一个非球形的LNP,我们可以看到它由一个主体和一个类似“耳朵”的“出芽”(bleb)组成。在没有染色时(左图),“出芽”内部呈现一种模糊的斑驳状密度。而一旦用硫堇染色(右图),这个“出芽”内部的密度立刻变得极深,而被染色的恰恰就是mRNA!这雄辩地证明了,在这种形态的LNP中,mRNA并非与脂质核心混合,而是“独居”在一个充满溶剂的、与主体分离的“出芽”隔间里。这与之前许多认为mRNA与脂质紧密复合的模型形成了鲜明对比。

  • pH驱动的“搬家”:为了进一步验证这个发现,科学家做了一个巧妙的实验(图3d)。他们将LNP置于pH=5的酸性环境中(模拟内涵体的环境)。我们知道,LNP中的可电离脂质在酸性条件下会带上正电,从而能与带负电的mRNA强烈结合。结果不出所料,原本位于“出芽”中的mRNA真的“搬家”了,它从“出芽”中迁移出来,与LNP的主体紧密结合在一起,留下了空空如也的“出芽”。这个实验不仅证实了“出芽”中的物质就是mRNA,也生动地展示了LNP响应酸性环境、改变内部结构的关键过程。

图3. 解构失效:纳米颗粒在压力下的“崩溃”瞬间

理解LNP的结构不仅是为了满足好奇心,更是为了解决实际问题,比如药物的稳定性。这款mRNA疫苗在运输和储存中会不会失效?又是如何失效的?

这张图为我们提供了一个纳米级的“事故现场快照”。研究人员对染过色的LNP样品进行了反复冻融的物理压力测试,模拟了储存和运输中可能遇到的恶劣条件。

Cryo-EM图像(图4a)清晰地揭示了LNP的降解路径:

  • “出芽”解离:一些LNP的“出芽”结构会从主体上脱落,形成独立的、包裹着mRNA的囊泡结构。

  • mRNA泄漏:蓝色箭头指向的游离出来的丝状物,正是从破损LNP中泄漏出来的mRNA。

  • 颗粒聚集与破裂:不稳定的LNP会相互聚集,形成更大的团块(右侧),甚至有的LNP(黑色箭头)像一个即将破裂的气球,显示出其内部结构已经崩溃。

这些直观的图像,为药物制剂的开发提供了宝贵的线索,帮助科学家理解LNP失效的微观机制,从而开发出更稳定、更可靠的mRNA药物。

他山之石,可以攻玉

这篇研究的精髓,远不止于拍出了几张漂亮的照片,它为整个药物递送领域提供了深刻的启示。

1.核心科学思想:从“推测”到“看见”的跨越。 期以来,对LNP内部结构的认知多依赖于小角度X射线散射(SAXS)等间接测量手段和分子动力学模拟,好比“盲人摸象”,众说纷纭。这项工作的核心设计哲学是“眼见为实”,它通过一个极其巧妙的“染料+电镜”组合,将最关键的组分——mRNA,从复杂的背景中凸显出来,实现了从推测到直接观察的飞跃。这种化繁为简、直击要害的思路,是科学研究中的一种高超智慧。

2.背景与横向对比:重塑LNP结构模型。 此前,基于小分子siRNA的LNP研究提出的模型(如多层状结构)被广泛引用。但mRNA是个大分子,其封装机制是否相同一直存疑。这项工作直接证明了,对于mRNA-LNP,至少存在一种“核心-出芽”(core-bleb)共存的结构模型。mRNA可以处于一种与脂质主体分离、高度水合的状态。这解释了为什么不同批次的LNP形态各异,也提示我们,这些形态上的“缺陷”(如“出芽”)实际上可能是具有特定功能的重要结构域,而非简单的瑕疵。

3.未来展望与深刻见解:开启理性设计新篇章。 这项研究打开了潘多拉的盒子,引出了一系列激动人心的新问题:

  • 功能关联性: mRNA“住”在“出芽”里和“住”在核心里,哪种状态的疫苗效果更好?其稳定性、细胞内释放效率有何不同?

  • 可控制造: 我们能否通过调控生产工艺(如混合速度、脂质配方),来精确控制mRNA最终的“居住形态”,从而实现对疫苗效力的“按需定制”?

  • 应用拓展: 这个强大的可视化技术,可以作为一个高效的筛选工具,用于快速评估和优化新型LNP递送系统,大大加速新药的研发进程。

总而言之,Moderna团队的这项工作,如同一座灯塔,照亮了LNP这个“黑匣子”的内部世界,标志着我们对mRNA药物递送的理解进入了一个全新的、更直观的时代。

参考文献

Brader ML, Williams SJ, Banks JM, Hui WH, Zhou ZH, Jin L. Encapsulation state of messenger RNA inside lipid nanoparticles. Biophys J. 2021 Jul 20;120(14):2766-2770. doi: 10.1016/j.bpj.2021.03.012. Epub 2021 Mar 25. PMID: 33773963; PMCID: PMC8390897.

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