编辑丨王多鱼
排版丨水成文
增强子-启动子（enhancer-promoter，E-P）相互作用，在细胞命运决定过程中调控基因转录。然而，E-P 相互作用的调控机制，目前仍不清楚。
2025 年 12 月 16 日，中山大学丁俊军教授联合四川大学华西二院肖雪教授、南方医科大学深圳眼科医院迟玮教授、徐州医科大学白津教授、暨南大学中医学院范丽丽博士（中山大学姜少帅、刘心仪、章主恒、杨明珠为论文共同第一作者）在 Nature Genetics 期刊发表了题为：JMJD2 regulates enhancer-promoter interactions via biomolecular condensate formation 的研究论文。
该研究开发了可鉴定特定染色质互作上蛋白组分（Looposome）的新技术——LoopID。作为目前唯一的基于染色质结构的蛋白质组学方法，LoopID 技术基于细胞内真实发生的染色质折叠，为解析特定染色质三维结构如何被介导、如何发挥功能提供了全新的工具。
在这项最新研究中，研究团队提出了一种基于染色质相互作用的蛋白质组学方法——LoopID，用于分析特定 E-P 锚点处的蛋白质（looposome）。该研究发现，组蛋白去甲基化酶 JMJD2 作为 looposome 的关键组分，能够通过形成生物分子凝聚体以非催化依赖的方式调控 E-P 相互作用及 looposome 功能。进一步，研究团队开发了一种在特定基因组位点组装 JMJD2 凝聚体来工程化 E-P 相互作用的系统，从而能够构建细胞类型特异性的 E-P 相互作用以促进细胞重编程为多能性或类二细胞期细胞。
该研究揭示了组蛋白去甲基化酶在染色质组织调控中的非经典功能，并为通过 E-P 相互作用调控细胞命运转变提供了新策略。
https://www.nature.com/articles/s41588-025-02415-8
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