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数谱生物G4 Cut&Tag(DNA G4)新品发布!

数谱生物G4 Cut&Tag(DNA G4)新品发布! Aksomics康成生物l数谱生物
2025-11-11
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一、简介

DNA G-四链体(G4s)是由富含鸟嘌呤的序列形成的非典型核酸结构,其由四股螺旋组成,通过鸟嘌呤四联体和单价阳离子(例如K⁺)稳定。G-四链体在转录调控、端粒维持和基因组稳定性等关键生物过程中发挥着重要作用。由于与癌症和神经退行性疾病等疾病的紧密关联性,G-四链体受到了广泛关注。


二、技术原理

G4 Cut&Tag是一种尖端的基因组分析技术,旨在以高分辨率和特异性绘制DNA G-四链体(G4)结构。该方法整合了G4特异性抗体、pA-Tn5转座酶融合体以及原位捕获。G4特异性抗体BG4能够特异性结合到轻度通透化细胞内的天然G4结构,从而保持其体内构象。将一个Protein A/G-Tn5转座酶复合体连接到抗体上,该复合体在Mg²⁺激活后,会在G4位点附近的DNA处进行切割,同时插入测序接头。与ChIP-seq不同,G4 CUT&Tag绕过了染色质片段化(超声处理)、交联和免疫沉淀步骤,从而将背景噪声和信号丢失降至最低。数谱生物G4 Cut&Tag 服务使用Arraystar公司开发的G4 CUT&Tag Library Prep Kit试剂盒进行建库,保证了实验的高质量和高效率。

图1. G4 Cut&Tag工作原理示意图。

样本需求:细胞数目 > 5x105个;组织 > 200mg。

物种:有基因组信息。


三、实验流程

1.细胞准备:将组织或细胞样品制成细胞悬液并检查细胞活力;

2.G4结合一抗BG4;

3.BG4结合二抗;

4.ProteinA-Tn5融合蛋白结合并片段化DNA,同时加接头;

5.纯化DNA片段,构建文库;

6.上机测序,进行数据分析;

7.提供结果报告。


四、技术优势

1.天然G4结构捕获技术:相比传统方法,它能捕获更多保留其体内天然构象的G4结构。这是因为传统ChIP-seq技术中染色质片段化时的剪切力及其他去垢剂,往往会破坏G4结构或使其变形。

2.分辨率更佳:相较于传统G4 ChIP-seq技术,能检测到更多G4峰。

3.高灵敏度:通过更低的背景噪声与更高的信噪比,实现精准定位。

4.流程高效:文库制备可在24小时内完成。

5.样本量要求低:适用于稀有样本分析。


五、测序结果展示

1. Cut&tag富集peak检出结果表格

2.Cut&tag鉴定到的差异peak表格

3.Cut&tag差异peak的火山图、相关基因的GO和KEGG富集分析

相关服务:

R-loop Cut&Tag

G-loop检测 (G4&R-loop Cut&Tag)

RNA G-四联体 (rG4)芯片

Cut&tag

R-loop测序(DRIPc-seq) 


【声明】内容源于网络
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数谱(上海)生物科技有限公司(Aksomics)是国内专业提供生命科学前沿研究技术服务的高科技企业。其总部位于上海,目前已在国内成立了10多家办事处,主要致力于为生命科学和临床医学等领域开发和提供创新性基因芯片、二代测序、质谱等技术服务
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