大数跨境
0
0

《每周一文》001——TAK-279的故事

《每周一文》001——TAK-279的故事 爱思益普
2023-08-25
4

爱求索、思新异、益中国、普创新。

为鼓励大家跟踪前沿专利和文献,工作中保持积极学习的心态,员工自发组织了《每周一文》系列文章,旨在阅读并梳理文章中的关键技术和结果,结合公司的新药研发平台,寻求拓展,希望能助力更多创新的研究团队,支持“产学研医药”大融合。

今年特大的药物转让新闻,莫过于TAK-279,一款基于计算机药物设计优化的TYK2抑制剂,也是多种严重炎症和自身免疫性疾病的重点开发方向[1]。TAK-279是一种口服的TYK2选择性变构抑制剂,被Takeda(武田制药)认为在银屑病以及其他多种免疫介导的疾病(包括炎症性肠病、银屑病关节炎和系统性红斑狼疮)中表现出最佳疗效、安全性和便利性。在1期临床研究中,TAK-279显示出良好的耐受性、探索性临床活性的剂量依赖性趋势、以及支持每天一次固体口服用药的药代动力学特征。针对该药物的2期临床试验正在进行中。

故事开始之前,讲一讲JAK家族中的关键成员——TYK2。(文末有惊喜)


01

TYK2的结构及生物学功能介绍

1.1 TYK2的结构

JAK是Janus Kinase的缩写,而Janus取自罗马神话中的“两面神”雅努斯。传说中它有前后两张面孔,所以发现它的科学家们借用这个神话人物来形容JAK家族的标志性特征,即存在两个十分相似的结构域。

TYK2,其在结构上具有高度同源性,由7个不同结构域组成,从C端到N 端分别命名为JH1-JH7(图1.1)。根据JAK 家族结构域的功能差异,7个不同结构域可分成4个不同功能域:JH1(激酶结构域)是腺嘌呤核苷三磷酸活性位点所在结构域,负责底物磷酸化。JH2(假激酶结构域)与 JH1 结构相似,但缺乏催化功能,参与调控 JH1 催化活性。JH3-JH4(SH2 :同源 2 结构域)用以稳定 JAK构象。JH5-JH7 (FERM :同源结构域)。

图1.1 TYK2靶点结构示意图[2]


1.2 TYK2的功能

JAK-STAT 信号通路是细胞因子信号传导的重要途径,参与人体内细胞增殖、分化、凋亡及免疫调节等过程。TYK2 是 JAK-STAT 通路中的一种关键信号转导激酶,在传递炎症因子和免疫应答方面具有重要的作用。

白细胞介素或干扰素与受体特异性结合后导致受体二聚化,随后招募 JAK 蛋白向受体细胞质聚集并磷酸化激活 JAK。与此同时活化的 JAK 磷酸化 STAT 蛋白,STAT 形成二聚体并转运至细胞核内,与目标基因启动子结合后调节特定基因的表达[3]

JAK 抑制剂能够与 JAK 蛋白的ATP 位点结合并抑制 JAK 的磷酸化激活,由此破坏下游的级联反应,导致自身免疫性疾病、炎症等疾病相关基因转录减少(图1.2)。


图1.2 JAK-STAT 信号通路和 JAK 抑制剂作用机理[3]


02

TYK2与疾病的关系及药物TAK-279的研究进展

2.1 TYK2与疾病的关系

作为一种重要的信号传导激酶,相比其他类型的JAK抑制剂,TYK2所影响的通路谱更窄,由此安全性隐患更小。在迄今为止试验中,TYK2抑制剂还没有出现在其他JAK抑制剂试验中报告过的严重副反应。

TYK2 参与 IL-12、IL-23 和Ⅰ型 干扰素的信号传导,且 IL-12 和 IL-23 的异常表达会引起银屑病、类风湿性关节炎、狼疮和炎症性肠病等自身免疫性疾病[4-9]。研究发现,选择性抑制TYK2已成为治疗自身免疫性疾病的潜在策略。


2.2 靶向 TYK2 抗肿瘤药物TAK-279的研究进展

氘可来昔替尼(Deucravacitinib)也叫做BMS-986165,由百时美施贵宝公司研发,于2022年9月首获FDA批准上市,主要用于治疗成年中重度斑块状银屑病[10]。该药也是全球第一款获批上市的TYK2抑制剂,并被评为年度重磅药物分子之一。同样,TAK-279是一种有效的、选择性的TYK2(JH2)抑制剂,2023年正处于治疗癌症的2期临床试验中[11](图2.1)。

图2.1 TYK2抑制剂TAK-279的化学结构式[11]


在Silvana Leit等人2023年发表的文章 “Discovery of a Potent and Selective Tyrosine Kinase 2 Inhibitor: TAK-279”一文中详细介绍了一种强效选择性酪氨酸激酶2抑制剂—TAK-279。


文章中提到,针对化合物与JH2结构域的结合进行虚拟筛选。首先限制了空间属性,从650万个商业化合物中筛出240万个类药及类先导分子。再根据与JH2结构域的结合打分等过程,最终筛出了3个母核片段(图2.2)。


Nimbus公司使用自由能微扰技术(FEP+)计算设计的配体对TYK2的JH2和JH1结合位点的结合力,同时也需要考虑配体在溶剂和蛋白中的熵和焓效应,以及蛋白质残基的局部动力学和second-shell效应。最后再经过药物化学改造确定了候选分子NDI-034858(TAK279)的结构(图2.1)。

图2.2 虚拟筛选确定了3个苗头化合物母核片段[11]


文献报导了6种小分子化合物,3种JH1 TYK2小分子选择性抑制剂, 1(Brepocitinib)、2 (ropsacitinib) 3(Nimbus compound 3), 和3种JH2 TYK2 抑制剂,4(Deucravacitinib )、5(BMS-986202) 、 6a and 6b (BMS compounds)对不同激酶靶点的酶学检测结果(图2.3)。

图2.3 6种化合物对4种不同激酶靶点的酶学检测结果[11]


以下是Silvana Leit在文献中提到TAK279和Deucravacitinib两种TYK2抑制剂在不同实验方法中的IC50数值对比。对比发现在human TYK2 JH2 的实验中,TAK-279对TYK2信号通路的抑制效果更强。

图2.4 TAK-279和Deucravacitinib在不同实验中的IC50数值比较 [11]

在体内实验中,构建了大鼠佐剂性关节炎(AIA)模型,30只(n=9/组)。研究化合物30(TAK-279)在大鼠中的药效(图2.5)。

图2.5 Rat AIA Model(TAK-279)


根据Silvana Leit文章中的结果整理TYK2靶点化合物研发一体化流程路线图,其中包括酶学实验,细胞学实验,DMPK,体内模型构建等。

图2.6 根据Silvana Leit文章整理的TAK-279研发一体化流程路线图 [11] 

(需要上图可添加小爱说药:beijingice123)


03

北京爱思益普在 TYK2靶点上的研究进展

3.1 酶学的研究进展

在表观遗传学靶点的平台拓展和方法研究方面,爱思益普研发团队积级开展了靶向治疗中TYK2靶点的研究和分析,分别通过HTRF Assay和ADP Glo Assay检测方法验证不同浓度抑制剂非戈替尼(Filgotinib)和托法替尼(Tofacitinib)对JAK家族四个激酶靶点的抑制作用(图3.1,图3.3),其中,非戈替尼对JAK1/ JAK2/ JAK3/ TYK2激酶的抑制IC50值分别为40/45/1113/320,检测结果和文献给出的结果对比1≤Ratio≤3(图3.2)。

图3.1 Filgotinib对JAK靶点的抑制作用


图3.2 Filgotinib抑制检测结果和文献对比

图3.3 Tofacitinib对JAK靶点的抑制作用


同时,酶学团队通过FP酶学检测方法验证不同浓度抑制剂BMS-986165对TYK2 JH2结构域的抑制作用(图3.4,图3.5)

图3.4 BMS-986165对TYK2靶点的抑制作用


图3.5 FP酶学检测方法作用机理


3.2 细胞学的研究进展

3.2.1 报告基因的研究进展

爱思益普细胞学研发团队通过“Reporter assay”的细胞学开发方法自主研究了不同抑制剂对不同Reporter细胞体系和对应信号通路的影响,其中构建的细胞系包括IFN-α/β reporter cells、IFN-γ reporter cells、IL-12 reporter cells、IL-23 reporter Cells、IL-22 reporter Cells、IL-6 reporter Cells等。

下图是Reporter实验中干扰素和白细胞介素(IFN-α/β、IFN-γ、IL-12、IL-23、IL-22、IL-6)的信号通路和作用机理(图3.6)。

图3.6 JAK-STAT 信号通路和作用机理[12]

不同抑制剂对JAK-STAT 信号通路的检测结果图,其中包括Tofacitinib抑制剂对IL-23、IFN-α/β、IFN-γ介导信号传导的IC50值,检测其IC50值分别为0.754uM、0.023uM、0.581uM(图3.7)。

图3.7 Tofacitinib对不同细胞因子JAK-STAT 信号通路的抑制作用


同时,使用BMS986165抑制剂对IL-23、IFN-γ、IL-6、IFN-α/β、IL-22、IL-12介导信号传导的IC50值,检测其IC50值分别为0.007 uM、4.539uM、94.36uM、0.001uM、0.007uM、0.006uM(图3.8)。

图3.8 BMS-986165对不同细胞因子JAK-STAT 信号通路的抑制作用


3.2.2 原代细胞和全血的研究进展

爱思益普研发团队通过“ELISA,AlphaLIS,FACS”等方法研究了不同抑制剂对离体细胞体系和对应信号通路的影响,离体体系主要包括人外周血单个核细胞(Human peripheral blood mononuclear cells, hPBMC),人原代T细胞、人原代单核细胞以及人全血等,其中,Tofacitinib抑制剂对IL-2、IL-4、IFN-α、IL-15等介导信号传导的STAT磷酸化IC50值如下图展示(图3.9)。

图3.9 Tofacitinib对不同离体体系JAK-STAT 信号通路的抑制作用


BMS986165抑制剂对IL-10、IFN-α介导信号传导的STAT磷酸化IC50值如下图展示(图3.10)。

图3.10 BMS986165对不同离体体系JAK-STAT 信号通路的抑制作用


Ruxolitinib抑制剂对血小板生成素(TPO)介导信号传导的STAT3磷酸化IC50值如下图展示(图3.11)

图3.11 Ruxolitinib对不同离体体系JAK-STAT 信号通路的抑制作用


为了深化TYK2靶点一体化的研发,根据以上实验的结果,并查阅大量文献,爱思益普创新研发部在公司自有优势平台的基础上,完善并构建了TYK2靶点研发一体化流程路线图,其中包括了酶学实验,细胞学实验,药物代谢和药代动力学,体内实验,CDX模型构建等(图3.12)。

图3.12 爱思益普生物TYK2靶点化合物一体化研发流程路线图


结语:

北京爱思益普生物科技股份有限公司(ICE Bioscience InC.)专注于从先导化合物到临床前候选分子阶段,基于生化、细胞、体内模型、安全性评价等筛选技术和早期药物的机理研究,致力于建立全面的靶点筛选、优化的研究平台。

同时,爱思益普拥有一流的实验设备平台,包括HCS、Western Blot、qPCR、LC-MS、MSD等,助力靶点的精准分析和验证。此外,爱思益普可以提供数百种肿瘤及其他细胞,在实验中积累了大量的研发经验,为后期TYK2靶向药物的开发及优化提供坚实的基础。

爱思益普团队走在药品研发科技领域的前沿,深入研究靶点药物的作用机理并时刻关注着药品研发的最新动向,以优质的服务和科技创新为根本,不断优化实验方法,不断科研创新,竭诚为国内外客户提供研发和检测服务,加速中国新药研发项目的进程。


撰稿人----王海超、黄聪



参考文献:

[1] Lluís R,Luis P. Tyk2 Targeting in Immune-Mediated Inflammatory Diseases[J]. International Journal of Molecular Sciences,2023,24(4).

[2] Decker T, Meinke A. JAKs, STATs and the immune system[J].Immunobiology,1997, 198

(1/2/3): 99-111.

[3] 王力勋,朱佩钰,周金培等.选择性酪氨酸激酶2抑制剂的研究进展[J].药学进展,2022,46

(05):379-387.

[4] 余艳平,陈程,范昭泽等.用于治疗银屑病的新型选择性TYK2抑制剂氘可来昔替尼(Deucravacitinib)[J/OL].中国皮肤性病学杂志:1-11[2023-07-26].DOI:10.13735/j.cjdv.1001-7089.202211112

[5] Nogueira M, Puig L, Torres T. JAK inhibitors for treatment of psoriasis: focus on selective TYK2 inhibitors[J]. Drugs, 2020, 80(4):341-352.

[6] Hawkes J E, Yan B Y, Chan T C, et al. Discovery of the IL-23/IL-17 signaling pathway and the treatment of psoriasis[J]. J Immunol, 2018, 201(6): 1605-1613.

[7] Tektonidou M G. JAK inhibitors: promising for a wider spectrum of autoimmune diseases[J]. Lancet, 2019, 394(10214): 2047-2048.

[8] Bryan M C, Rajapaksa N S. Kinase inhibitors for the treatment of immunological disorders: recent advances[J]. J Med Chem, 2018,61(20): 9030-9058.

[9] He X R, Chen X B, Zhang H C, et al. Selective TYK2 inhibitors as potential therapeutic agents: a patent review (2015-2018) [J]. Expert Opin Ther Pat, 2019, 29(2): 137-149.

[10] Highly Selective Inhibition of Tyrosine Kinase 2 (TYK2) for the Treatment of Autoimmune Diseases: Discovery of the Allosteric Inhibitor BMS-986165. Journal of Medicinal Chemistry 2019 62 (20), 8973-8995.

[11] Silvana L, Jeremy G, Samantha C, et al. Discovery of a Potent and Selective Tyrosine Kinase 2 Inhibitor: TAK-279. [J]. Journal of medicinal chemistry,2023.

[12] Salas A, Hernandez-Rocha C, Duijvestein M, et al. JAK-STAT pathway targeting for the treatment of inflammatory bowel disease. Nat Rev Gastroenterol Hepatol. 2020;17(6):323-337.

公司介绍



关于爱思益普
北京爱思益普生物科技股份有限公司2010年成立,专注于从靶点发现验证、先导化合物筛选、优化到临床前候选分子阶段的创新药一体化生物学服务平台,在肿瘤,免疫,心血管,中枢神经系统等疾病领域的生物学和药理学研究技术,打造创新型CRO+的探索者。爱思益普关注新药研发企业对速度、效率和成本的需求,用专业的技术和高效的沟通帮助客户提高新药研发的效率。

爱思益普建立的技术平台包括:
1.基于靶点的药物筛选平台:建立了超过100种离子通道,150多种GPCR,超过1000种激酶和酶学靶点以及40多核受体筛选细胞系及验证方法,涵盖了大部分成药性靶点。
2.体外和体内药效筛选评价平台:包括肿瘤免疫,心血管,中枢神经系统基于细胞、组织或动物模型的药效学评价。
3.早期成药性筛选评价平台:包括早期ADME和PK研究,早期药物脱靶效应筛选(hERG,safety panel,激酶谱等)

爱思益普2022年完成过亿元B轮融资,在北京、上海、徐州和贵阳设有实验室和商务中心,目前实验室面积超过17000平方米,超过400名员工,仪器设备投入超过1亿元。爱思益普建立了强大的技术团队,其中博士近10%,硕士以上占比超过40%。2人入选北京市“海聚工程”海外高层次人才及北京市特聘专家;亦庄“亦麒麟”创业领军人才。是国家高新技术企业,中关村高新技术企业。2016年被认定为北京经济技术开发区“企业研发机构”和“公共技术服务平台”;2018年获得“德勤-亦庄高科技高成长20强”;2021年获北京市科委平台重大项目支持;2021年被认定为北京市企业科技研究开发机构;2022年获得北京市“专精特新”中小企业。

截至目前,爱思益普为600家以上的国内新药研发机构提供服务,得到客户广泛好评;每年有数百个项目进行新药临床研究(IND)申报,多个项目通过NMPA的现场核查。


【声明】内容源于网络
0
0
爱思益普
北京爱思益普生物于2010 年成立,专注于从先导化合物筛选,优化到临床前候选分子阶段基于细胞和生化的药物体外筛选技术和早期药物机理研究,关注肿瘤,免疫,心血管,中枢神经系统等疾病领域的生物学和药理学研究技术,打造创新型CRO+的探索者。
内容 194
粉丝 0
爱思益普 北京爱思益普生物于2010 年成立,专注于从先导化合物筛选,优化到临床前候选分子阶段基于细胞和生化的药物体外筛选技术和早期药物机理研究,关注肿瘤,免疫,心血管,中枢神经系统等疾病领域的生物学和药理学研究技术,打造创新型CRO+的探索者。
总阅读329
粉丝0
内容194