辛辛苦苦做实验取到样本,经过裂解、煮样、跑胶等WB步骤后,曝光后的条带却一片空白、模糊不清、背景脏乱……这些问题的出现,有可能在煮样这步就错了!
有人说这么简单的操作会出问题?不就是把样品放在金属浴煮上三五分钟的事情吗?并不是这样的!煮样是WB实验的关键步骤之一,操作不当可能直接导致蛋白降解、聚集或得率低下。今天我们就来聊聊煮样这件事。
煮样到底在煮什么?
煮样不仅仅就是把样品加热煮沸,其主要目的是让蛋白质变性并保持稳定。
细胞或组织中的蛋白质大多是折叠状态,空间结构复杂。煮样能促进SDS与蛋白质充分结合,让蛋白质完全变性、解聚成带负电荷棒状结构,利于按分子量进行电泳分离;可破坏维持蛋白质高级结构的非共价键,使其成线性结构,确保迁移率仅与分子量相关;能有效灭活蛋白酶,避免靶蛋白被降解;还能提高蛋白样品稳定性,减少聚集沉淀,去除气泡杂质。
总之,煮样确保了所有蛋白分子以均一、线性且带负电的状态进行后续电泳分离,其操作失败可能会影响WB结果。
煮样实操
加入蛋白loading buffer并充分混匀溶液,置于95-100℃煮样5-10 min,随后将样品离心置于冰上备用。
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注:煮样时间可根据蛋白浓度、分子大小、上样缓冲液比例等因素进行调整。如蛋白浓度高,可适当增加煮样时间,但最好不超过10 min,时间过长蛋白会出现凝固,导致无法进行后续实验。
煮样后的蛋白样品应尽快使用,如需要保存,短期保存可放置于4℃,长期保存应将样品置于-20℃,或分装后置于-80℃保存,避免反复冻融,通常可以保存一年以上,但建议3个月内使用。
彻底变性的蛋白在短期内重新电泳上样,无需再次煮沸。但当样品中出现颗粒物质或聚集物、样品长期储存变得浑浊或出现沉淀时,建议重新煮样。
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注意!煮样不要一刀切
WB实验中,并不是所有样本都要煮沸,如多次跨膜蛋白样本高温煮沸可能会导致膜蛋白聚集,聚集以后的蛋白可能无法正确进入凝胶迁移,堵在孔里;核蛋白样本不建议进行高温煮沸处理,直接离心取上清后上样即可;热敏感的蛋白煮沸处理会导致它们迅速降解。
那该怎么做呢?
膜蛋白:通过预实验确定膜蛋白的处理条件,比如设置温度梯度,在50-70℃加热10-15分钟,或者添加强效去污剂辅助溶解,如1% LDS、0.5% Triton X-114。
核蛋白:将样本直接与4℃预冷的loading buffer混合,利用低温环境避免蛋白结构被破坏。
热敏感蛋白:37℃放置10-30min,使用低温去污剂,如1% LDS
综上可知,WB电泳前制样的热变性不是一煮了事那样简单,要掌握不同蛋白的特性,避开煮样和操作中的误区,这样实验的成功率会大幅提升。
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