大数跨境
0
0

PubMed+DeepSeek:1天完成1篇综述初稿(协和博士实操教学)

PubMed+DeepSeek:1天完成1篇综述初稿(协和博士实操教学) MedCite学术引擎
2025-02-28
0
导读:使用pubmed.pro完成综述初稿实操教程

很多人都说可以用DeepSeek写综述,但大家如果真去尝试就会发现:AI写的综述内容很浅显,AI味很浓,没办法达到研究生/博士生的水平。那么作为一名研究者,如何充分利用DeepSeek和pubmed真正写出一篇有深度的文献综述呢?

今天的内容,来自一位武汉协和医院博士用户的投稿,我们将以她的真实经验为例,展开具体的实操讲解。如何从零开始,撰写一篇综述初稿。

本次教程使用的工具是我们上次分享的pubmed.pro,它的优势是会结合PubMed真实的SCI文献,拒绝瞎编,让AI进行真实的科研写作,详情可以查看这篇推文

   STEP 1. 定选题

都说万事开头难,定选题是开启一篇文章最核心的部分,我们可以让pubmed.pro阅读海量的文献,帮助我们找到大致的研究方向,节约我们大量阅读文献的时间。例如:我想写一篇1型糖尿病疾病相关性的研究进展综述,通过pubmed.pro帮我选定一个题目,AI即可给出不同方向的选题及研究内容(每个方向都参考了最新的SCI文章)。

   STEP 2. 定框架

题目选定好后,就需文章的整体框架目前的AI还无法完成长篇论文的写作,因此,我们需要先定好文章的框架,然后让AI逐步完成每部分的内容,最后再进行合并。

例如我们想要写1 型和 2 型糖尿病的心血管结局的综述,可以先让AI为我们生成一个“1型和2型糖尿病的心血管结局的综述文章的框架。

以下为pubmed.pro生成的内容框架

左右滑动查看pubmed.pro生成的框架


而后我们人工进行判断框架的完整性、标题的合理性以及内容的选取,最后根据生成的内容,制定了最终的文章框架:

  • 糖尿病合并心血管疾病流行病学
  • 不同类型糖尿病合并心血管疾病的病理生理学
  • 糖尿病导致心血管疾病的危险因素
  • 糖尿病的心血管疾病结局
  • 1型和2型糖尿病的心血管疾病结局比较
  • 1型和2型糖尿病的结局趋势
   STEP 3. MeSH词及检索式

框架制定好后,就可以通过检索词进行内容搜索,pubmed.pro可以根据我们的需要,自动判断检索内容

如果你想要进行更深层次的综述写作,可以使用MeSH词搜索和自由词检索相结合的方式。MeSH词搜索方法的教程网上有很多,小编这里就简单说明一下:

1.我们先打开Pubmed官网,点击左下角的“MeSH Database”,以1型糖尿病为例,我们搜索type 1 diabetes,页面中可以看到我们需要的主题词、副主题词以及自由词;

2.然后我们点击需要的搜索词,先点击“Add to search builder”,再点击“Search Pubmed”进行搜索;

3.随后点击搜索框下方的“Advanced”跳转至高级检索页面,在这个页面中我们可以看到我们搜索过的历史。如果我们要对这些关键词都进行搜索,就需要用到布尔逻辑,Pubmed也提供了这个功能;

3.对于第一个关键词,只需要点击左侧的三个点,选择“Add query”,既可显示在上方的“Query box”中;

4.如果我们要加入第二个关键词,仍然点击三个圆点,其中就出现了布尔逻辑的选项,由于我们需要用“OR”的关系,我们点击“OR”后,这个关键词就会加入“Query box”

5.如果我需要限制搜索仅标题和摘要,那我们可以在最上方“Add terms to the query box”,在下拉栏中选择“Title/Abstract”,然后输入我们需要搜索的关键词,点击ADD,然后就会加入到Query box中。

往右滑动->查看MeSH词搜索教程

   STEP 4. 每段内容的AI撰写

我们准备撰写第一章:1型和2型糖尿病的心血管疾病流行病学,我们先搜索“糖尿病合并心血管疾病流行病学并加上近五年和影响因子大于等于5分的限定,这样文献库中的文献都是最新且高分的,可以先不选深度思考,因为要自己修改关键词,这样不容易卡。

点击关键词进行修改,输入搜索策略

((((((("Diabetes Mellitus, Type 1"[Mesh]) OR ("Diabetes Mellitus, Type 2"[Mesh])) OR (type 1 diabetes)) OR (type 2 diabetes)) AND ("Cardiovascular Diseases"[Mesh])) AND ("Prevalence"[MeSH])) OR ("Epidemiology"[Mesh])) OR ("Incidence"[MeSH])

待文献库构建完成后再次输入问题,小编采用的Prompt提示词为:帮我写一章关于【糖尿病合并心血管疾病流行病学】的综述章节,选择深度思考以下为AI写的初稿内容。

AI生成的“糖尿病合并心血管疾病流行病学

可以看到内容已引用对应文献,我们也可以对字数、详细程度、语言风格进行调整。
在调整到满意后,可以看到目前生成的内容相对较为零散,分段较细,我们可以使用deepseek微调内容,将全文复制到deepseek里,加上以下指令:
  • 请你将下面的文字连接起来成为几段话,并保留参考文献编号,作为综述的一个小节,小节名称为:糖尿病合并心血管疾病流行病学

deepseek优化后的内容


这样我们一个章节的内容就已经完成好啦!我们可以将生成的内容和文献复制进word中,为后续整合做准备。

Tips:关于prompt提示词,请不要写:请列出参考文献,使用最近5年的文献,字数不少于2万字等等。因为pubmed.pro的参考文献会自动列出来,而文献的年限和IF影响因子也是在首页手动选择的,告诉AI是没有用的哦~

是不是很简单!我们用同样的步骤再尝试撰写第二章“不同类型糖尿病合并心血管疾病的病理生理学”,采用的检索式为:
(((((((((((((("Diabetes Mellitus, Type 1"[MeSH]) OR ("Diabetes Mellitus, Type 2"[MeSH])) AND ("Cardiovascular Diseases"[MeSH])) OR ("Atherosclerosis"[MeSH])) OR ("Myocardial Ischemia"[MeSH])) OR ("Heart Failure"[MeSH])) OR ("Stroke"[MeSH])) AND ("Endothelium, Vascular/physiopathology"[MeSH])) OR ("Insulin Resistance"[MeSH])) OR ("Hyperglycemia"[MeSH])) OR ("Oxidative Stress"[MeSH])) OR ("Inflammation"[MeSH])) OR ("Glycation End Products, Advanced"[MeSH])) OR ("Dyslipidemias"[MeSH])) OR ("Diabetic Neuropathies"[MeSH])
在更改关键词后,重新提问:不同类型糖尿病合并心血管疾病的病理生理学,以下为AI撰写内容:

AI生成的“不同类型糖尿病合并心血管疾病的病理生理学”


然后将内容复制到DeepSeek内,用同样的方法输出段落式内容:

deepseek优化后的内容

看完以上步骤,相信各位小伙伴已经掌握了如何使用AI撰写各章节内容了吧,小编这里就不一一赘述了。

   STEP 5. 内容整合并生成摘要和总结

我们对每一章节的内容进行检查修改后,合并到word中,使用Endnote或其他文献软件对文献引用进行标注。在完成对所有章节的处理后,我们得到了一份综述正文,现在就差摘要和结论部分了。

接下来可以将这份文件上传至deepseek输出摘要和总结:

为了证明AI生成的内容是否合理、全面,小编找到了一篇相似的文章,发表在《Diabetologia》IF=8.4的综述“Cardiovascular outcomes in type 1 and type 2 diabetes”,通过AI生成的内容基本都已涉及,说明按照这个方法撰写的综述是靠谱的。

当然AI写出的初稿肯定有不完美的地方,这个时候我们再通过人工校对修改,就可以完成最终的定稿了。

这样一篇综述初稿就完成啦,是不是很简单!大家可以按照这个教程试试哦。如果觉得这篇教程还不错,可以点赞分享给身边的朋友哦。点击这里查看pubmed.pro工具的详细介绍。

【声明】内容源于网络
0
0
MedCite学术引擎
基于PubMed的科研AI工具MedCite学术引擎。集学术AI、文献检索、PDF翻译、IF影响因子、文献管理于一体的科研学术引擎。
内容 93
粉丝 0
MedCite学术引擎 基于PubMed的科研AI工具MedCite学术引擎。集学术AI、文献检索、PDF翻译、IF影响因子、文献管理于一体的科研学术引擎。
总阅读31
粉丝0
内容93